治療艾滋病用的是抗逆轉錄藥物。目前有四類抗逆轉錄藥物：

核苷類逆轉錄酶抑制劑（NRTI）：這種藥物分子結構和自然的脫氧核苷酸相似，可以代替脫氧核苷酸被新增到DNA鏈上，使DNA合成終止。齊多夫定，拉米夫定，替諾福韋（一線），恩曲他濱（一線）屬於這類藥。

非核苷類逆轉錄酶抑制劑（NNRTI）：這種藥物分子結構和核苷完全不同。它是和逆轉錄酶的其它部位結合使逆轉錄過程無法進行。奈韋拉平，依非韋倫屬於這類藥。

蛋白酶抑制劑（PI）：和蛋白酶結合抑制蛋白酶的活性。

整合酶抑制劑（INSTI）：和整合酶結合抑制整合酶的活性。

雞尾酒療法是聯合使用三種抗逆轉錄藥物治療艾滋病，像雞尾酒把不同的酒混在一起而得名。但這三種藥不是隨便搭配的，必需含有兩種核苷類逆轉錄酶抑制劑和一種其它型別的藥。雞尾酒療法的應用克服了抗藥性的問題，第一次讓長期控制艾滋病成為可能，因而成為標準的治療手段（standard of care）。

雞尾酒療法也可以用在其它變異能力很強的病毒，比如丙肝病毒。目前吉利德的第三代泛基因型丙肝藥就是由NS5B抑制劑和NS5A抑制劑兩種藥組成的。艾伯維正在開發的泛基因型丙肝藥也是由NS5A抑制劑和NS3抑制劑組成的。