其原因主要是：

主要表現為缺磷缺鉀缺鋅等營養元素，缺失這些營養元素時水稻移栽以後，返青慢分櫱慢，葉片不披僵直縮苗不長。嚴重者秧苗根系黑根黑頭，拔除來近聞還有腐臭味。

水稻僵苗縮苗不長與多種因素有關。比如秧苗移栽以後，長時間低溫陰雨光照少，地溫回升慢積溫不足時可致水稻秧苗生理機能失調，根系生長髮育不好時影響根系對土壤中各類營養元素的吸收，或者是各類營養元素吸收以後不能被水稻秧苗有效利用時，就出現營養性缺失的生理障礙。

對於水稻營養性生理缺失障礙引起的水稻僵苗縮苗不長時，可以用植調劑和多功能葉面肥復配使用即可矯正營養性生理障礙。

比如可以用0.1%蕓薹素內酯水劑2000~2500倍液與氨基酸多功能葉面肥五穀豐50g/桶水復配使用，或者0.1%誘抗素水劑1500~2000倍液與多功能葉面肥稀施美4O~50g/桶水復配使用，或者1.8%奈乙酸生根粉與多功能葉面肥綠之源50g/桶水復配使用，矯正效果很好。

地下害蟲如水稻長腿根葉甲，水稻根葉甲，水稻象甲，水稻搖砂蟲，水稻根結線蟲等危害水稻根系，致水稻根系生長髮育不良，而影響了根系從土壤中汲取各種營養。

地下害蟲對水稻的危害有直接危害和間接危害等兩種方式。直接危害多半與根系生長髮育有關。間接危害與水稻的生長環境有關。

因此在防控地下害蟲危害時，建議使用顆粒劑撒施的效果比較好。但是，如果要配合葉面使用藥劑時，也可以用乳油，水劑或微乳劑。

如在水稻秧苗僵苗縮苗不長時，可用5%辛硫磷顆粒劑600~800g/畝或者0.5%阿維菌素顆粒劑800~1000g/畝或者3%毒死蜱顆粒劑600~800g/畝撒施即可。切禁不用呋喃丹等禁用高毒農藥顆粒劑。

除噴藥撒施農藥顆粒外，還可以用速效性氮肥進行提苗。如每畝可以用15~20斤尿素進行根外追施，對於因氣溫回升原因影響的水稻僵苗縮苗坐蔸不長等症狀，這個辦法還是挺實用的。但前提是必須對症用藥以後才追施，如若僅靠用尿素提苗來恢復生長，是根本做不到的。

其次是田間的水層不要灌得太深。水層太深影響水稻根系發育。可以適量保持1~2寸水層養生，多餘的水層可以放去。

水稻“蔥管”（俗稱標蔥）現象的發生，通常有兩種可能性：一、可能是使用激素類除草劑（二甲四氯、二氯喹啉酸）導致的，二、也可能是稻癭蚊為害引起的。

激素類除草劑引起的的“蔥管”為緊實的實心蔥管狀，使用激素類除草劑，水稻幼苗極易受到藥害。植株矮化，畸形，莖杆褪色不能正常抽出，捲曲，老葉黃化，莖基環狀、腫脹、黴爛，生出短粗次生根，嚴重時全株死亡。

稻癭蚊危害引起的為空心蔥管狀，稻癭蚊幼蟲吸食水稻生長點汁液，致使受害稻苗基部膨大，心葉停止生長葉鞘伸長形成淡綠中空的蔥管。

水稻遭遇除草劑藥害，要及時採取正確補夠措施：洗田排毒、清洗受害植株、追施速效有機肥料及微肥、使用解毒劑助劑，噴施生長調節劑。

水蔥狀稻苗主要有兩種情況，一種是由稻癭蚊為害，為空心蔥管狀，仔細剝開中空的蔥管可看到乳白色稻癭蚊幼蟲；一種是使用二甲四氯、二氯喹啉酸等激素類除草劑，為實心蔥管狀，葉色濃綠，有的葉片扭曲畸形。從圖片看，水稻處於分櫱期，葉片有些發黃，並未看出植株像水蔥似的，可能是使用二氯喹啉酸是加入了其他除草劑引起。

為害症狀：稻癭蚊主要以幼蟲刺吸生長點汁液，導致水稻秧苗基部膨大，心葉停止生長且葉鞘伸長形成中空的蔥管，從秧苗期至孕穗期均可受害，影響分櫱及抽穗，從而導致減產。

判斷方法是剝開病株莖基部，看蔥管中是否有蟲蛹，若發現稻癭蚊幼蟲，則可判定位稻癭蚊為害。

防治方法：可選用3%呋喃丹顆粒劑或用3%毒死蜱顆粒劑拌細土撒施，注意保持水層。

水稻移栽返青後也正是施用除草劑的時候，施用過早或過量施用二氯喹啉酸容易造成水稻出現藥害，表現出葉色濃綠，分櫱慢，心葉蔥管捲曲。蔥管苗出現的症狀一般在施藥後半月左右明顯，因此也可能是秧田用藥問題。