棲息地破碎是指大塊的、連續的自然棲息地被人類活動的棲息地如農田和居民點等分割為面積較小的多個棲息地碎片的過程。棲息地破碎化是促使物種瀕危和滅絕的重要因素。棲息地破碎會減少棲息地面積，改變棲息地的空間結構和碎片間的生態過程，包括改變輻射流、水迴圈、營養迴圈、傳粉過程、捕食者和被捕食者的相互作用等。對於許多物種而言，破碎化導致個體在適宜棲息地板塊間的遷徙變得更加困難，種群變得更小，減少了斑塊間的基因流並可能導致區域性滅絕。
棲息地破碎後可能產生下列效應：
（1）碎片面積可能小於物種所需的最小巢區或領地面積，即使碎片面積較大，由於碎片上的種群較小，也不能維持種群的長期生存。
（2）棲息地異質性損失，一些需要幾種棲息地型別才能生存的物種因棲息地異質性減少而導致種群瀕危或滅絕。
（3）擁擠效應，碎片上週圍棲息地的某些物種可能在碎片上增加密度，對碎片上的物種的種群造成危害，促使其瀕危。
（4）邊際效應，碎片受到周圍環境的影響，在碎片邊緣形成一種受影響的區域，對碎片內的物種極為不利，減少碎片內部的有效面積。
（5）隔離效應，一些需要季節性遷徙的物種可能會因碎片鍵的隔離而無法正常遷徙，導致種群瀕危或滅絕。例如，修建大壩可能妨礙許多水生動物的繁殖或破壞其季節性的遷徙模式，如三峽大壩的建立，可能對中華鱘、白鰭豚和白鶴的生存構成威脅。
破碎化效應對物種瀕危的影響是十分複雜的。破碎化通常伴隨著棲息地面積的喪失和棲息地空間位置的改變，但這兩個變化對種群的影響可能是不同的。將棲息地破碎（空間格局）和棲息地喪失對物種瀕危和滅絕的相對影響分開，對於確定保護對策有一定意義。假如棲息地破碎對種群滅絕閾值有較大影響，那麼對於保護來說，改變棲息地將是一個有效的方法；若棲息地破碎相對於棲息地喪失的影響很小，那麼保護物種的重點應放在阻止棲息地喪失和恢復棲息地上。
棲息地破碎是指大塊的、連續的自然棲息地被人類活動的棲息地如農田和居民點等分割為面積較小的多個棲息地碎片的過程。棲息地破碎化是促使物種瀕危和滅絕的重要因素。棲息地破碎會減少棲息地面積，改變棲息地的空間結構和碎片間的生態過程，包括改變輻射流、水迴圈、營養迴圈、傳粉過程、捕食者和被捕食者的相互作用等。對於許多物種而言，破碎化導致個體在適宜棲息地板塊間的遷徙變得更加困難，種群變得更小，減少了斑塊間的基因流並可能導致區域性滅絕。
棲息地破碎後可能產生下列效應：
（1）碎片面積可能小於物種所需的最小巢區或領地面積，即使碎片面積較大，由於碎片上的種群較小，也不能維持種群的長期生存。
（2）棲息地異質性損失，一些需要幾種棲息地型別才能生存的物種因棲息地異質性減少而導致種群瀕危或滅絕。
（3）擁擠效應，碎片上週圍棲息地的某些物種可能在碎片上增加密度，對碎片上的物種的種群造成危害，促使其瀕危。
（4）邊際效應，碎片受到周圍環境的影響，在碎片邊緣形成一種受影響的區域，對碎片內的物種極為不利，減少碎片內部的有效面積。
（5）隔離效應，一些需要季節性遷徙的物種可能會因碎片鍵的隔離而無法正常遷徙，導致種群瀕危或滅絕。例如，修建大壩可能妨礙許多水生動物的繁殖或破壞其季節性的遷徙模式，如三峽大壩的建立，可能對中華鱘、白鰭豚和白鶴的生存構成威脅。
破碎化效應對物種瀕危的影響是十分複雜的。破碎化通常伴隨著棲息地面積的喪失和棲息地空間位置的改變，但這兩個變化對種群的影響可能是不同的。將棲息地破碎（空間格局）和棲息地喪失對物種瀕危和滅絕的相對影響分開，對於確定保護對策有一定意義。假如棲息地破碎對種群滅絕閾值有較大影響，那麼對於保護來說，改變棲息地將是一個有效的方法；若棲息地破碎相對於棲息地喪失的影響很小，那麼保護物種的重點應放在阻止棲息地喪失和恢復棲息地上。