當初木葉忍者村的建立，是以千手一族和宇智波一族為主體，團結了其他各大忍者家族建立的忍者村，“木葉”中的木字就代表著千手一族的木遁，而葉代表的就是宇智波一族的團扇，可以說這個村子是兩大家族共同的心血，當初千手柱間和宇智波斑在亂世中為了大義而結蒙成一體，堪稱一段佳話，千手柱間本想將火影之位讓給宇智波斑，結果不僅村子裡的大家不理解，連宇智波一族的人對宇智波斑都不信任，一段禍根由此埋下。

千手和宇智波，這是整個木葉村裡最大的兩家，也是保證整個忍者村團結發展的基石，任何一家有了二心都可能會整個村子帶來毀滅性的打擊，隨著宇智波斑和千手柱間一場終結之戰，整個村子看似向著和平進步的一面發展，實際上卻是暗流湧動，宇智波一族不滿足於千手一族“霸佔”了木葉的領導權，矛盾積怨由此而來，到木葉警備隊成立，宇智波一族在木葉的聲望達到頂點，但是矛盾的積累也走到了頂點。直到時間變遷，直到三代目時代，矛盾激化越發嚴重，而此時宇智波一族暗含野心，同時木葉高層又有了一個野心不小的團藏，兩種化學反應交織在一起，真真如干柴遇烈火一般一觸即發。

在當時那種情況下，其實兩方還是有和解的可能的，但是兩方面負責實際執行的高層都各有鬼胎，導致心存和平願望的三代目的理想信念未能傳達出去，從而造成了裡宇智波一族的悲劇，木葉也因此大大的損害了自己的實力，這樣的做法，從短時間來看，一舉清除了木葉的隱患，但是從長期來看，應該還是有更好跟妥善的解決方法的。

火影中，三代是和平主義，理想仁愛之人。極力反對誅殺宇智波一族，多方保護佐助。而團藏是根的頭子，暗部，主張用暴力對抗暴力，寧可錯殺一千，不可放過一個。滅族的主張是團藏勾結火影村高層採取措施，而三代是事後知道，一切都晚了，無法挽救了。

一是因為宇智波斑死了。二是因為宇智波一族的天賦太強了！三是當時的宇智波一族中，沒有影級別的頂尖高手，被鼬一個上忍滅族了。