首先是三代年紀已經老了，和大蛇丸比會差一點，其次最重要的一點是初代和二代是穢土轉生出來的，第一次被轉生出來，力量與之前有很大的差距。並且三代沒有打敗初代和二代，而是用屍鬼封印迫不得已將初代，二代封印了，並且也搭上了自己的性命順便送上美圖

謝謝邀請。希望採納。首先是關於設定的問題，在初期三代火影被稱為“忍術博士”當時被穢土轉生的初代二代並不完美，實力發揮還不足五成，像是初代的仙術木遁，二代的速度最快都沒有體現。再加上初代二代即使被穢土轉生依舊保持了一定的思想，對待三代並沒有抱有打死的想法，而是抱著切磋然後被打敗的想法。至於打不過大蛇丸，蛇叔是三代的徒弟，即使叛逃，三代對於大蛇丸依舊抱有很強烈的感情，依舊希望蛇叔能夠回到木葉。再加上三代火影步入晚年，身體大不如巔峰時代。對於徒弟的心慈手軟和愛在最後的對決中導致失敗但也成功封印了大蛇丸的雙手。

1、官方沒有說三代可以贏初代二代，而且初代的血統除了同為阿修羅轉世的鳴人，其他火影很難比肩；

2、三代VS大蛇丸穢土出的初代、二代並將兩人封印，並不能說明三代勝於初代、二代，因為首先三代付出了生命的代價，其次當時初代、二代穢土的狀態實力只有生前的三成。

3、三代VS大蛇丸的時候已經是風燭殘年，而且是1VS3，而且在這種情況下還封印了大蛇丸的雙臂，已經很不錯了，不要對一個老頭苛求太多。

正面講是當時大蛇丸召喚出來的初代二代沒有以本尊的形態復活，力量可能也就兩三成。第二次招出來時因為融合了初代細胞所以他們以八九成的力量復活了。

反面講是作品本身的不嚴謹，一開始的設定似乎三代是最強火影，後期實力有些崩壞不得不創作出一個和當時的最終boss斑生前一個級別甚至更強的人物。這個人物只有在當時最強的忍者初代火影更為合適。