軟體著作權登記代辦費用一般包括兩部分：

　　一、申請費每個軟體300元(登記費250元，證書費50元)，直接繳入國庫;

　　二、代理費

　　具體說來，有250元/件次。該專案費用只限於程式及其一種文件的登記，如申請登記多種文件，每增加一種文件，增收80元。

　　例外交存手續費320元/件次。

　　軟體著作權合同登記費

　　每次100元

　　軟體著作權登記證書費

　　50/件

　　變更或補充登記費

　　150元/件次

　　請求延期處理費

　　第一次100元/件次，第二次200元/件次

　　軟體源程式封存保管費

　　100頁為120元，超過100頁的，每增加1頁增收2元

　　查詢費

　　計算機資訊庫查詢費

　　題錄庫查詢，近五年資訊：每題50元，超過100條，每條加收0.15元，追溯查詢(五年前)，每題75元，超過100條，每條加收0.25 元;文摘庫查詢，近五年資訊，每題10元，超過3頁，每頁加收0.25元，追溯查詢(五年前)，每題15元，超過3頁，每條加收0.25元;著作權概況查詢，近五年資訊，每題100元，超過3頁，每頁加收0.25元，追溯查詢(五年前)，每題125元，超過3頁，每條加收0.25元;

　　紙介質查詢費

　　對指定登記號的檔案進行查閱，每件次收費2元，如需影印加收復印費

計算機軟體著作權登記免費。

根據財政部《關於清理規範一批行政事業性收費有關政策的通知》（財稅[2017]20號）的規定，從2017年4月1日起停止收取軟體著作權登記費。

軟體著作權登記費包括：

1. 軟體著作權登記申請費（含申請例外交存手續費）；

2. 軟體著作權登記證書費；

3. 軟體著作權合同登記費；

4. 變更或補充登記費；

5. 軟體源程式封存保管費；

6. 查詢費；

軟體著作權登記如果透過代理辦理，一般費用為500元每件（受理後31個工作日出證書），西南地區（四川、重慶、雲南、貴州）軟體著作權登記218元每件，華東地區（上海、江蘇、浙江、山東、福建）軟體著作權著作權登記僅需318元每件當然如果需要短時間拿到證書是可以透過代理加急的，費用也是幾百元到幾千元不等，時間越短費用肯定就越高，在這裡明確一點就是加急並不是透過什麼關係辦到的，都是需要繳納規定的加急費用的