目前蔬菜的農藥殘毒的檢測主要有三種方法：生物檢測、生化檢測和理化檢測(氣譜、液譜)檢測。三種檢測方法各有優點和缺點

1.理化檢測可以透過氣譜儀或液譜儀分析，比較準確地定性定量確定蔬菜農藥殘毒，可以作為取締市場上蔬菜農藥殘毒超標依據，但裝置較昂貴、操作手續較複雜、檢測所需時間也較長。

2.生化檢測是將乙醯膽鹼酯酶從生物體中分離出來與微量的農藥殘毒作離體試驗，其優點是靈敏度較高、結果比較穩定，但它只能檢測出對乙醯膽鹼酯酶具有抑制作用的有機磷類或氨基甲酸酯類殺蟲劑的殘毒，對其它類的農藥殘毒則無法檢測。同時它只能測出蔬菜是否“有毒”，而不能具體測出殘毒農藥的種類和準確含量。

3.生物檢測在這裡是指以敏感家蠅為材料，以這種家蠅接觸供測蔬菜以後的中毒程度，來判斷供測蔬菜的含毒程度。其優點是檢測所需要時間較短(約3～4小時)，方法簡便，所需裝置不多，可以在較短時間內從大量蔬菜樣品中篩選出農藥殘留“超毒”樣品，適合對分散來源的商品蔬菜檢測，更有利於生產地蔬菜收穫前的田間農藥殘毒情況檢測。但這種方法只能檢測蔬菜的農藥殘留是否“超毒”．而無法檢出“超毒”的具體農藥品種及其準確的殘留量。透過田間檢測可以教育菜農合理使用農藥，並可控制超毒蔬菜流人市場。

參考資料：汪雅谷 張四榮主編,無汙染蔬菜生產的理論與實踐,中國農業出版社,2001年02月第1版

現在市面上的蔬菜基本都使用過農藥，沒有使用的都被打上了綠色食品的標籤，單價高的嚇人，是否有農藥殘留很容易辨別，不過是否使用過農藥就很難辨別了，不過聯絡地域特點也是可以推斷一二的，現在菜市場大多數為散戶種植的菜，他們沒有完善的設施裝置，所以在多蟲害地區和季節買到看相完美的蔬菜就要注意了。

對於“買菜買有蟲眼的沒有農藥”這一說法，其實沒有科學道理。因為菜農噴藥時很難做到同一時間內殺死全部害蟲，時間長了，害蟲會產生抗藥性，當菜農再噴藥時它們會逃開，隨後再“殺將回來”。因此，蔬菜上留有蟲眼未必就沒有農藥殘留