根據土地獲得的時間不同，規定也有所不同，如何處置也有所不同；

1982年前，農村村民建房佔用的宅基地面積，，在《村鎮建房用地管理條例》實施後，未擴大佔地面積的，可以按照現有實際面積確權登記；

1982年~1987年，農村村民建房超佔面積，首先要按照國家和當地的規定處理後（一般就是繳納相關費用），方能按照實際使用面積進行確權登記；

1987年後，農村村民建房超佔的宅基地面積，可在土地登記簿和土地權利證書記事欄內註明，今後分戶建房或面臨拆遷、改建等，將能夠按照規定處理，但實際確權的面積只能是當地規定的面積；

從上述宅基地超佔面積如何確權的問題中，我們就能看出來，1982年前屬於無規可依，1982年到1987年雖然有規但是無法可依，因此，對於超佔面積，是給予確權登記的；而自1987年《土地管理法》出臺後，還存在超佔宅基地問題，則屬於“知法犯法”，因此，只能夠按照規定面積予以確權登記；

這和超佔面積是否有徵地補償是一樣的處理方式，就拿北京市舉例，1982年以前的部分，能夠按照區、縣人民政府的規定給予適當補償，而1987年以後的部分，只能給按照規定的面積予以補償，多出的部分退還給村集體；

具體面積規定：

近郊區和遠郊區人多地少的鄉村：最高不得超過0.25畝（166平方米）；

其他地區，最高不得超過0.3畝（200平方米）；

但是，1982前劃定的宅基地，多於上述規定標準的，每戶按照最高不超過0.4畝（266平方米）從寬處理；

1997年第二輪土地承包開始就首先確定了宅基地問題。宅基地面積劃分為三間房子二分七釐地、四間房子三分三釐地，房屋院子超出面積頂該戶的一等承包田面積，不足的宅基地在承包田中補齊。這就充分說明農戶宅基地是屬於集體組織的。已經按承田分下去了。