辯證思維方法是一種思想態度，是在長期實踐經驗中對自己的思維方式所進行的自我反思而得到的一種自覺的“醒悟”。有的人有不自覺的、天然的辯證思維，未經哲學反思，自己並不知道自己具有辯證思維方法。比如：大局觀、整體觀、矛盾觀、發展觀……等等，這些都是辯證思維方法的表現。而現代科學思維方法是由科學實踐產生的、按照自然科學本身的客觀實踐邏輯所產生的思維方法，其特點是以嚴格的數理邏輯進行分析判斷，以實踐資料為最根本的依據進行邏輯思考，這就是現代科學思維方法的特點。另外，辯證思維方法和現代科學思維方法最根本的區別就是物件不同，辯證思維的物件是思維方式本身，是對人、對己的。而自然科學思維的物件是人與自然界的相互作用過程。這是根本的區別。如果把自然科學思維方法用到人本身，必然導致機械化、教條化、非人性化的思維方法貽害社會。

辯證思維方法是主客相統一的方法，但是強調主觀會更多。現代科學思維方法是邏輯實證統一的方法，更加強調理性和經驗的現實一致。科學思維脫胎於古希臘的物理（自然）學。而辯證法遊離於物理學，倫理學和論理學之間，而不侷限於物理學。三種學問劃分是古希臘哲學家的共識，邏輯學歸屬於論理學範圍，是作為工具論來理解的。從現代數學來理解，數理邏輯屬於離散數學範疇，而辯證邏輯因為不是單純的符號形式，把四因論（形式因，質料因，動力因，目的因）全綜合了，所以辯證法的未來綜合預測（思辨）的特點從根子上脫離不了。從這個角度看來，現代科學思維方法與哲學的分析主義的方法是非常一致的，而辯證思維方法與歐洲大陸綜合理性主義的方法一致。辯證思維總會遊離出物理學進入到倫理學，大談國家和國際主義，服務與政治博弈和思想導向。