1.轉染效率：慢病毒較高

2.慢病毒可以實現穩定轉染，腺病毒是瞬時轉染

3.包裝量：慢病毒可以包裝4kb左右，不超過8kb的外源基因，腺病毒可以包裝8kb左右外源基因

4.慢病毒操作較方便，週期也短。但腺病毒表達快，1-2天，慢病毒要2-4天。

5.安全性：兩個差不多

6.感染細胞型別：都可以感染分裂和不分裂的細胞

7.免疫原性：腺病毒高免疫原性，慢病毒低免疫原性

8.腺病毒不能得到轉基因動物，慢病毒可以

9.產生的病毒滴度，腺病毒要高些

慢病毒（Lentivirus）載體是以 HIV-1 （人類免疫缺陷1型病毒）為基礎，使用皰疹病毒VSVG 外殼蛋白髮展起來的工具載體。其毒性基因已經被剔除並被外源性目的基因所取代，屬於假型病毒。慢病毒具有感染譜廣泛特點，並且可以有效感染分裂和非分裂細胞。一經感染宿主細胞，慢病毒即利用反轉錄酶將其RNA轉錄成雙鏈DNA，隨後永久的整合到宿主細胞的染色體中，實現長時間穩定表達。腺病毒（Adenovirus）是一種線性雙鏈DNA無包膜病毒，對分裂期細胞和非分裂期細胞均具有感染能力，且具有嗜上皮細胞性。重組腺病毒載體是以腺病毒為基礎發展起來的工具病毒載體，具有宿主範圍廣，免疫原性強，基因容量大，不與基因組整合，瞬時表達等特點。