發熱門診設立的目的並不是單純的診療發熱性疾病，而是篩查發熱病人中的傳染病患者。因為很多傳染病，尤其是烈性傳染病初期多有發熱的症狀，所以為應對可能出現的傳染病，避免交叉感染，方便管理，必須和其他門診隔離開。

發熱門診獨立是因為發熱本身病勢急、病情複雜的特點所決定的。並不是人為想當然獨立就獨立的。

首先，只要是有發熱症狀出現的病證都要優先解決發熱，所以把發熱門診獨立出來，先解決發熱的問題，剩下的具體病證再交給相應的科室解決。所以發熱門診是個治療急症的地方。

其次，很多急危重症都可能出現高熱且病勢急迫，需要特病特辦。比如很多傳染性疾病就有發熱，今年的新冠，再加上之前的禽流感、非典這些。這些傳染病本身就要早發現早隔離早治療，發熱門診就是一個很好地發現和解決這類棘手問題的地方。

還有就是有很多急危重症的副反應也會出現發熱，比如大葉性肺炎、急性腎盂腎炎、急性膽囊炎等等。這個時候要和相關科室一起處理病人轉危為安。

所以獨立出來是有著周密的考慮的，而且不偏僻，要是都偏僻找不到，豈不是急死人了。

發熱門診用於排查疑似傳染病人，診斷治療發熱患者。醫院發熱門診一般都是獨立設定，區分開普通患者就診動線和發熱病人就診動線，避免交叉感染。除非老醫院，用地緊張或以前的設計並未考慮等因素，發熱門診不得不設定在綜合樓裡時，也儘量分割槽設定的。