水面和水下發射戰略導彈除了隱蔽問題外，還有以下主要不同：

1，水下發射承受的水壓較大，發射更復雜。水下發射時，潛艇一般處在水下30-50米的深度，先向發射筒內充氣，使筒內壓力與筒外海水壓力相等，再將發射筒蓋開啟，筒口的隔膜把水隔開，然後啟動發射動力推動導彈向上運動，衝破筒口隔膜，進入水中，繼而衝出水面上升到空中，火箭發動機自行點火，按預定軌道飛向目標。

導彈出水後，大量海水湧入筒內，然後關閉筒蓋，把部分多餘的海水排入專用水艙後再排出艇外，使筒內的海水重量與導彈重量相等，以保持潛艇的平衡。

水上發射相對簡單些，對發射時的海水壓力小。

2，水下發射後導彈要在水中飛行幾十米，當時海況的情況（如海流、海浪、海水阻力等)對導彈執行軌跡的影響較大,進而可能會用想到落點的精度，所以必須進行修正；而在水上發射受到的影響相對較小。

熱發射和冷發射，其實就是指導彈發動機點火的時機問題，與水下水面發射狀態無關。

導彈在發射筒內點火以本身的推力發射稱為“熱發射”，也叫“自力點火”、“溼式發射”或“靜力發射”；利用艇上獨立的燃氣發生器製造高壓蒸汽把導彈推出去，待導彈離開艇體後再點火，這種方式稱為“冷發射”，也叫“彈力發射”、“乾式發射”或“動力發射”。

據我所瞭解，過去俄羅斯的導彈多采用液體燃料，多是用“熱發射”，推力大，出水後導彈姿態不易受海水波浪的影響。

目前各國核潛艇的戰略導彈發射方式好像都是“冷發射”。

因為冷發射優勢較多，如可以節省推進劑在發射井內的消耗，減去導彈尾部很厚的防護罩，降低發射重量和達到導彈小型化；減少發射筒內的防護設施，使筒內構造簡單，造價低廉，增加了筒內的容積，可以配置更大直徑的導彈；筒內不受燃氣和火焰的影響等。