細胞器是細胞質的基質中具有一定形態和功能，並有被膜的結構。
細胞器分為：線粒體；質體（葉綠體、有色體、白色體）；內質網；高爾基體；核糖體；溶酶體；微體；液泡；細胞骨架。
線粒體是細胞進行有氧呼吸的主要場所。又稱”動力車間”.
葉綠體是綠色植物進行光合作用的場所。
內質網是蛋白質合成和加工的場所。
高爾基體對來自內質網的蛋白質加工，分類和包裝的場所。
核糖體是生產蛋白質的場所。
溶酶體分解衰老，損傷的細胞器，吞噬並殺死入侵的病毒或細菌。
液泡是調節細胞內的環境，是植物細胞保持堅挺。含有色素。
內質網（endoplasmic reticulum）
一般真核細胞中都有內質網，只有少數高度分化真核細胞，如人的紅細胞以及原核細胞中沒有內質網。在電鏡下可以看到內質網是一種複雜的內膜結構，它是由單層膜圍成的扁平囊狀的腔或管，這些管腔彼此之間以及與核被膜之間是相連通的。內質網按功能分為糙面內質網(rough ER)和光面內質網(smooth ER)兩類。糙面內質網上所附著的顆粒是核糖體，它是蛋白質合成的場所。因此糙面內質網最主要的功能是合成分泌性蛋白質，膜蛋白以及內質網和溶酶體中的蛋白質。所合成蛋白質的糖基化修飾及其摺疊與裝配也都發生在內質網中。其次是參與制造更多的膜。 光面內質網上沒有核糖體，但是在膜上卻鑲嵌著許多具有活性的酶。光面內質網最主要的功能是合成脂類，包括脂肪、磷脂和甾醇等。
核糖體(ribosome)
核糖體是蛋白質合成的場所，它是由rRNA和蛋白質構成的，蛋白質在表面，rRNA在內部，並以共價鍵結合。核糖體是多種酶的集合體，有多個活性中心共同承擔蛋白質合成功能。而每個活性中心又都是由一組特殊的蛋白質構成，每種酶或蛋白也只有在整體結構中才具有催化活性。
每一細胞核心糖體的數目可達數百萬個，遊離核糖體合成細胞質留存的蛋白質，如膜中的結構蛋白；而附在內質網上的核糖體合成向細胞外分泌的蛋白質，合成後向S-ER輸送，形成分泌泡，輸送到高爾基體，由高爾基體加工、排放。
高爾基體(Golgi apparatus)
由一系列扁平小囊和小泡所組成，分泌旺盛的細胞，較發達。在電鏡下得到確認的高爾基體是由單層膜圍成的扁平囊和小泡，成堆的囊並不像內質網那樣相互連線。在一個細胞中高爾基體只有少數幾堆，至多不過上百
（1）是細胞分泌物的最後加工和包裝的場所，分泌泡透過外排作用排出細胞外
（2）能合成多糖，如粘液，植物細胞的各種細胞外多糖。
溶酶體(lysosomes)
溶酶體是由單層膜包裹的小泡，數目可多可少，大小也不等，含有60多種能夠水解多糖，磷脂，核酸和蛋白質的酸性酶，這些酶有的是水溶性的，有的則結合在膜上。溶酶體的pH為5左右，是其中酶促反應的最適pH。 根據溶酶體處於，完成其生理功能的不同階段，大致可分為：初級溶酶體，次級溶酶體和殘餘小體。 溶酶體的功能有二：一是與食物泡融合，將細胞吞噬進的食物或致病菌等大顆粒物質消化成生物大分子，殘渣透過外排作用排出細胞；二是在細胞分化過程中，某些衰老細胞器和生物大分子等陷入溶酶體內並被消化掉，這是機體自身重新組織的需要。
線粒體(mitochondria)
線粒體具有雙層膜結構，外膜是平滑而連續的界膜；內膜反覆延伸折入內部空間，形成嵴。內外膜不相通，形成膜腔。光鏡下，線粒體成顆粒狀或短桿狀。線粒體是細胞內產生ATP的重要部位，是細胞內動力工廠或能量轉換器。線粒體具有半自主性，腔內有成環狀的DNA分子和核糖體，它們都能自行分化，但是部分蛋白質還要在胞質內合成。
葉綠體(chloroplas)
高等植物葉綠體外行如凸透鏡，具有雙層膜結構，兩膜間沒有聯絡。在葉綠體內部存在複雜的層膜結構，它懸浮於基質中，這些層膜又叫類囊體(thylakoids)，與葉綠體內膜可能無聯絡。類囊體也是雙層膜結構，呈扁盤狀。類囊體通常是幾十個垛疊在一起而成為基粒（grana），類囊體膜上有光合作用的色素和電子傳遞系統。
在綠色植物和藻類中普遍存在的葉綠體是光合作用場所。同時葉綠體也有自己特有的雙鏈環狀DNA，核糖體和進行蛋白質生物合成的酶，能合成出一部分自己所必需的蛋白質，因此葉綠體內共生起源假說為許多人所認可。
微體（microbodies）
含有酶的單層膜囊泡狀小體,與溶酶體功能相似，但所含的酶不同於溶酶體。微體在短時間內幫助多種物質轉換成別的物質。
過氧化物酶體(peroxisomes)是存在於動植物細胞的一種微體，其中所含的一些酶可將脂肪酸氧化分解，產生過氧化氫。
乙醛酸迴圈體(glyoxisome)存在與富含脂類的植物細胞中，其中一些酶能將脂肪酸核油轉換成酶，以供植物早期生長需求。
液泡(vacuole)
在成熟的活的植物細胞中經常都有一個或數個大的充滿液體的中央液泡，是在細胞生長和發育過程中由小的液泡融合而成的，是單層膜包圍的充滿水液的泡。液泡中含有無機鹽、氨基酸、糖類以及各種色素等代謝物，甚至還含有有毒化合物，並處於高滲狀態，使細胞處於吸漲飽滿的狀態。
細胞骨架（cytoskeleton）
在真核細胞的細胞質中普遍存在由蛋白質纖維組成的三維網架結構—細胞質骨架，蛋白質纖維包括有微管，微絲和中間纖維三種，它們透過透過磷酸化和去磷酸化而具有自裝配和去裝配功能，這也是資訊傳遞過程。細胞質中各種細胞器，酶和很多蛋白質都是固定在細胞質骨架上，使之有條不紊地執行各自的功能。
細胞質骨架網路系統對於細胞形態構建，細胞運動，物質運輸，能量轉換，資訊傳遞，細胞分化和細胞轉化等起著重要的作用。
微絲(microfilaments)
微絲（肌動蛋白纖維）是指真核細胞中由肌動蛋白組成的骨架纖維。微絲的功能：肌肉收縮，微絨毛，應變纖維，胞質環流和阿米巴運動，胞質分裂環。
微管(microtuble)
微管由α，β兩種型別的微管蛋白亞基組成，兩種蛋白形成微管蛋白二聚體，是微管裝配的基本單位。微管是由微管蛋白二聚體組成的長管狀細胞器結構，微管壁由13個原纖維排列組成，微管可裝配成單管，二聯管（纖毛和鞭毛中），三聯管（中心粒和基體中）。微管的功能：維持細胞形態，細胞內運輸，鞭毛運動和纖毛運動，紡錘體和染色體運動，基粒與中心粒。
中間纖維(Intermediate filaments)
中間纖維蛋白合成後基本上都裝配成中間纖維，遊離的單體很少。在一定生理條件下，在植物細胞中也存在類似中間纖維結構。中間纖維按其組織來源和免疫原性可分為6類：角蛋白纖維，波形纖維，結蛋白纖維，神經纖維，神經膠質纖維和核纖層蛋白。 中間纖維與微管關係密切，可能對微管裝配和穩定有作用。此外，中間纖維從核纖層透過細胞質延伸，它不僅對細胞剛性有支援作用和對產生運動的結構有協調作用，而且更重要的是中間纖維與細胞分化，細胞內資訊傳遞，核內基因傳遞，核內基因表達等重要生命活動過程有關。
鞭毛、纖毛和中心粒
（flagellum, cilium, centrioles）
細胞表面的附屬物，功能是運動。鞭毛和纖毛的基本結構相同，主要區別在於長度和數量。鞭毛長但少，纖毛短，常覆蓋細胞全部表面，兩者的基本結構都是微管。基部與埋藏在細胞質中的基粒（9（3）+0）相連。中心粒，結構與基粒相似，埋藏在中心體中，許多微管都發自這裡。
胞質溶膠（cytosol）
細胞質中除細胞器以外的液體部分。富含蛋白質，佔細胞內的25～50%；含有多種酶，是細胞代謝活動的場所；還有各種細胞內含物，如肝糖原、脂肪細胞的脂肪滴、色素粒等。
細胞器是細胞質的基質中具有一定形態和功能，並有被膜的結構。
細胞器分為：線粒體；質體（葉綠體、有色體、白色體）；內質網；高爾基體；核糖體；溶酶體；微體；液泡；細胞骨架。
線粒體是細胞進行有氧呼吸的主要場所。又稱”動力車間”.
葉綠體是綠色植物進行光合作用的場所。
內質網是蛋白質合成和加工的場所。
高爾基體對來自內質網的蛋白質加工，分類和包裝的場所。
核糖體是生產蛋白質的場所。
溶酶體分解衰老，損傷的細胞器，吞噬並殺死入侵的病毒或細菌。
液泡是調節細胞內的環境，是植物細胞保持堅挺。含有色素。
內質網（endoplasmic reticulum）
一般真核細胞中都有內質網，只有少數高度分化真核細胞，如人的紅細胞以及原核細胞中沒有內質網。在電鏡下可以看到內質網是一種複雜的內膜結構，它是由單層膜圍成的扁平囊狀的腔或管，這些管腔彼此之間以及與核被膜之間是相連通的。內質網按功能分為糙面內質網(rough ER)和光面內質網(smooth ER)兩類。糙面內質網上所附著的顆粒是核糖體，它是蛋白質合成的場所。因此糙面內質網最主要的功能是合成分泌性蛋白質，膜蛋白以及內質網和溶酶體中的蛋白質。所合成蛋白質的糖基化修飾及其摺疊與裝配也都發生在內質網中。其次是參與制造更多的膜。 光面內質網上沒有核糖體，但是在膜上卻鑲嵌著許多具有活性的酶。光面內質網最主要的功能是合成脂類，包括脂肪、磷脂和甾醇等。
核糖體(ribosome)
核糖體是蛋白質合成的場所，它是由rRNA和蛋白質構成的，蛋白質在表面，rRNA在內部，並以共價鍵結合。核糖體是多種酶的集合體，有多個活性中心共同承擔蛋白質合成功能。而每個活性中心又都是由一組特殊的蛋白質構成，每種酶或蛋白也只有在整體結構中才具有催化活性。
每一細胞核心糖體的數目可達數百萬個，遊離核糖體合成細胞質留存的蛋白質，如膜中的結構蛋白；而附在內質網上的核糖體合成向細胞外分泌的蛋白質，合成後向S-ER輸送，形成分泌泡，輸送到高爾基體，由高爾基體加工、排放。
高爾基體(Golgi apparatus)
由一系列扁平小囊和小泡所組成，分泌旺盛的細胞，較發達。在電鏡下得到確認的高爾基體是由單層膜圍成的扁平囊和小泡，成堆的囊並不像內質網那樣相互連線。在一個細胞中高爾基體只有少數幾堆，至多不過上百
（1）是細胞分泌物的最後加工和包裝的場所，分泌泡透過外排作用排出細胞外
（2）能合成多糖，如粘液，植物細胞的各種細胞外多糖。
溶酶體(lysosomes)
溶酶體是由單層膜包裹的小泡，數目可多可少，大小也不等，含有60多種能夠水解多糖，磷脂，核酸和蛋白質的酸性酶，這些酶有的是水溶性的，有的則結合在膜上。溶酶體的pH為5左右，是其中酶促反應的最適pH。 根據溶酶體處於，完成其生理功能的不同階段，大致可分為：初級溶酶體，次級溶酶體和殘餘小體。 溶酶體的功能有二：一是與食物泡融合，將細胞吞噬進的食物或致病菌等大顆粒物質消化成生物大分子，殘渣透過外排作用排出細胞；二是在細胞分化過程中，某些衰老細胞器和生物大分子等陷入溶酶體內並被消化掉，這是機體自身重新組織的需要。
線粒體(mitochondria)
線粒體具有雙層膜結構，外膜是平滑而連續的界膜；內膜反覆延伸折入內部空間，形成嵴。內外膜不相通，形成膜腔。光鏡下，線粒體成顆粒狀或短桿狀。線粒體是細胞內產生ATP的重要部位，是細胞內動力工廠或能量轉換器。線粒體具有半自主性，腔內有成環狀的DNA分子和核糖體，它們都能自行分化，但是部分蛋白質還要在胞質內合成。
葉綠體(chloroplas)
高等植物葉綠體外行如凸透鏡，具有雙層膜結構，兩膜間沒有聯絡。在葉綠體內部存在複雜的層膜結構，它懸浮於基質中，這些層膜又叫類囊體(thylakoids)，與葉綠體內膜可能無聯絡。類囊體也是雙層膜結構，呈扁盤狀。類囊體通常是幾十個垛疊在一起而成為基粒（grana），類囊體膜上有光合作用的色素和電子傳遞系統。
在綠色植物和藻類中普遍存在的葉綠體是光合作用場所。同時葉綠體也有自己特有的雙鏈環狀DNA，核糖體和進行蛋白質生物合成的酶，能合成出一部分自己所必需的蛋白質，因此葉綠體內共生起源假說為許多人所認可。
微體（microbodies）
含有酶的單層膜囊泡狀小體,與溶酶體功能相似，但所含的酶不同於溶酶體。微體在短時間內幫助多種物質轉換成別的物質。
過氧化物酶體(peroxisomes)是存在於動植物細胞的一種微體，其中所含的一些酶可將脂肪酸氧化分解，產生過氧化氫。
乙醛酸迴圈體(glyoxisome)存在與富含脂類的植物細胞中，其中一些酶能將脂肪酸核油轉換成酶，以供植物早期生長需求。
液泡(vacuole)
在成熟的活的植物細胞中經常都有一個或數個大的充滿液體的中央液泡，是在細胞生長和發育過程中由小的液泡融合而成的，是單層膜包圍的充滿水液的泡。液泡中含有無機鹽、氨基酸、糖類以及各種色素等代謝物，甚至還含有有毒化合物，並處於高滲狀態，使細胞處於吸漲飽滿的狀態。
細胞骨架（cytoskeleton）
在真核細胞的細胞質中普遍存在由蛋白質纖維組成的三維網架結構—細胞質骨架，蛋白質纖維包括有微管，微絲和中間纖維三種，它們透過透過磷酸化和去磷酸化而具有自裝配和去裝配功能，這也是資訊傳遞過程。細胞質中各種細胞器，酶和很多蛋白質都是固定在細胞質骨架上，使之有條不紊地執行各自的功能。
細胞質骨架網路系統對於細胞形態構建，細胞運動，物質運輸，能量轉換，資訊傳遞，細胞分化和細胞轉化等起著重要的作用。
微絲(microfilaments)
微絲（肌動蛋白纖維）是指真核細胞中由肌動蛋白組成的骨架纖維。微絲的功能：肌肉收縮，微絨毛，應變纖維，胞質環流和阿米巴運動，胞質分裂環。
微管(microtuble)
微管由α，β兩種型別的微管蛋白亞基組成，兩種蛋白形成微管蛋白二聚體，是微管裝配的基本單位。微管是由微管蛋白二聚體組成的長管狀細胞器結構，微管壁由13個原纖維排列組成，微管可裝配成單管，二聯管（纖毛和鞭毛中），三聯管（中心粒和基體中）。微管的功能：維持細胞形態，細胞內運輸，鞭毛運動和纖毛運動，紡錘體和染色體運動，基粒與中心粒。
中間纖維(Intermediate filaments)
中間纖維蛋白合成後基本上都裝配成中間纖維，遊離的單體很少。在一定生理條件下，在植物細胞中也存在類似中間纖維結構。中間纖維按其組織來源和免疫原性可分為6類：角蛋白纖維，波形纖維，結蛋白纖維，神經纖維，神經膠質纖維和核纖層蛋白。 中間纖維與微管關係密切，可能對微管裝配和穩定有作用。此外，中間纖維從核纖層透過細胞質延伸，它不僅對細胞剛性有支援作用和對產生運動的結構有協調作用，而且更重要的是中間纖維與細胞分化，細胞內資訊傳遞，核內基因傳遞，核內基因表達等重要生命活動過程有關。
鞭毛、纖毛和中心粒
（flagellum, cilium, centrioles）
細胞表面的附屬物，功能是運動。鞭毛和纖毛的基本結構相同，主要區別在於長度和數量。鞭毛長但少，纖毛短，常覆蓋細胞全部表面，兩者的基本結構都是微管。基部與埋藏在細胞質中的基粒（9（3）+0）相連。中心粒，結構與基粒相似，埋藏在中心體中，許多微管都發自這裡。
胞質溶膠（cytosol）
細胞質中除細胞器以外的液體部分。富含蛋白質，佔細胞內的25～50%；含有多種酶，是細胞代謝活動的場所；還有各種細胞內含物，如肝糖原、脂肪細胞的脂肪滴、色素粒等。