瞭解糞便的形成對於瞭解便秘和腹瀉都有幫助。 糞便的形成過種十分複雜，這是因為糞便的形成過程需要由胃、腸、肝、膽、胰、小腸、大腸、直腸等多個器官參與，食物從經口攝入到經肛門排出的過程又較長。 糞便的形成過程1食物經口咀嚼，經食道到達胃後，透過胃的消化，進入十二指腸，在此過程中又被加入了膽汁與胰液。小腸內容物到達結腸後，便成為結腸菌群的培養基，使菌群大量繁殖，其量可達結腸固形物的一半，並與其它成分一起，構成糞便，經每小時約5cm的速度，緩慢向遠端移動。 食物經小腸消化和吸收後，碳水化合物、脂肪、蛋白質等營養物質分別被分解成葡萄糖、脂肪酸、氨基酸等被機體吸收，大部分水分亦在此被重吸收。其液體狀殘渣流入大腸，經一段時間後水分被吸收，貯藏於乙狀結腸附近。 平時固態糞便貯存於乙狀結腸甚至降結腸中，直腸一般呈空虛狀態，直腸瓣以及恥骨直腸肌收縮形成的肛直角可阻止糞便進入肛管直腸，當乙狀結腸或更近端的結腸收縮時，可將糞便直接驅入直腸中，引起排便反射。如環境不允許排出，則盆底肌、恥骨直腸肌、外括約肌主動收縮，不讓糞便進入肛管，同時，直腸、結腸亦適應性鬆弛，使直腸內壓下降，便意逐步解除，如仍不理會便意，糞便將在直腸逆蠕動驅動下返回上方結腸。 結腸結構與功能直接影響結腸運動，因而與便秘的關係十分密切。影響結腸功能的因素很多，包括結腸的結構、結腸容積的大小、結腸黏膜的吸收功能、結腸的蠕動方式，結腸內壓力的改變、神經系統、激素、調節肽等。吸收功能主要影響腸內容物的性狀，結腸腸腔容積也可影響糞便的執行方式。