1、溫度。溫度控制是辣椒貯藏的基本條件。辣椒對低溫非常敏感。當溫度低於9℃時，易受冷害；當溫度高於13℃時，易老化、腐爛。辣椒夏季貯藏溫度一般為10℃－12℃，冷害溫度一般為9℃；秋季貯藏溫度一般為9℃－11℃，冷害溫度一般為8℃。採用兩段式溫度可以延長辣椒的貯藏期。

2、溼度。保證溼度也是辣椒貯藏的重要條件。辣椒貯藏適宜的相對溼度為90％－95％。辣椒易失水，低溼度會使果實失水枯萎。使用塑膠密封包裝袋可以很好地防止水分流失。

另一方面，辣椒對水非常敏感。密封包裝中的高溼度和高冷凝水會加速病原菌的活動和疾病的發展。因此，在裝袋前必須充分預冷，以保持溼度穩定。採用無滴膜和高透溼膜，加調溼膜可控制冷凝和過溼。

3、氣體。採用氣調貯藏是提高辣椒保鮮效果的有效途徑。控制氣藏的適宜氣指數一般為2％～7％氧氣和1％～2％二氧化碳。

包裝中過多的二氧化碳積累會導致萼片變成褐色和水果腐爛。目前，國內外常用PVC或PE塑膠小包裝進行空調製冷，但二氧化碳在儲存中的濃度往往很高，因此需要用二氧化碳吸收劑降低其濃度。

4、防腐。辣椒必須儲存，否則會引起大量腐爛，即使辣椒在收穫後立即放在合適的溫度下，也只能短期存放。如果要長期儲存，必須在入庫時儲存。可以說，防腐與其他貯藏條件的結合是辣椒貯藏的兩個重要環節。