一共四次。

第一次，木葉初建，五影議會初設，柱間和斑離世，雲隱反水，二代戰死，三代結束戰爭，重新平衡忍界。

第二次，忍界混戰，雨隱村大戰，三忍成名，但由於旗木白牙任重失敗，木葉攻防部署落入霧隱之手，木葉損失慘重，戰後白牙自殺。

第三次，此次為二次戰爭的延續，二戰後木葉實力大減，雲隱巖隱聯手攻擊木葉，新生力量水門力克雷影兄弟，神無毗橋以一敵千威振忍界，三戰結束。

第四次，忍界對抗月之眼計劃，史稱外掛戰爭，最終主角光環勝出。

第一次發生在戰國時期，那時候全世界都在打，忍者之前彼此之間不信任，陌生忍者見了面不敢告訴對方姓氏，忍者的世界一片混亂，持續的時間也最長，直到千手柱間的崛起，世界的劃分逐漸變得明朗，五大國崛起，達到一種微妙的平衡狀態。

第二次，由於國家間經濟發展的不平衡，各國忍村武鬥派勢力抬頭，先是三大忍村在雨隱村激戰，最終木葉勝利。第二年，戰爭轉入區域性式戰鬥，火之國進入風之國境內，雷之國進入土之國境內。就在這一年，第二次忍界大戰結束。

傳說中三忍的崛起，長門拜師，旗木朔茂殺死蠍的父母，“木葉白牙”聞名天下，加藤斷重傷致死，使綱手開始對火影不敬並患上暈血，都發生在這個時期。

第三次忍界大戰實際上是第二次忍界大戰的延續。始於各大忍國與國境附近的小國與忍者村戰爭衝突，波風水門在這次大戰中崛起，宇智波富嶽開啟萬花筒。

最後一次是宇智波帶土挑起的戰爭，目的是爭奪最後兩個人柱力，奇拉比跟鳴人，鳴人跟宇智波佐助在這次大戰中崛起，成為忍界的bug