其實故事是這樣：由於渚在小的時候有一次生病要死的，但是他老爸求神明讓她不要死，這時候奇蹟發生了，渚和土地的生命連線在了一起。　　但由於最近過度的人工開發導致土地的靈力下降所以渚死了一次（就是生汐的時候），這時候的朋也因為對渚的愛很深，所以自暴自棄當自己沒和渚遇到過結果就不願意接受汐的存在。　　晃盪了5年，後來由於早苗阿姨和朋也得祖母的幫助終於讓朋也看清楚了自己應該保護的人，和自己的自暴自棄的錯誤。於是這時候朋也和汐生活在了一起，但是故事是曲折的。命運並沒有放棄對朋也一家的捉弄。這時候汐也生病了，而且和渚一樣，後來發現汐繼承了母親的體制和大地連在了一起，所以最後汐在雪地裡朋也得懷抱裡死去了。然後朋也也因為失去生活的東西一起死了。　　故事到這沒有結束，由於某種神奇的力量朋也復活在了幻想世界，成為和少女在一起的機器人，最後由於冬天的降臨少女停止了活動（不是死，是停止活動）最後少女和機器人說了句“再見，爸爸”喚醒了朋也得記憶。　　這時候命運的輪盤又開始了轉動，朋也復活了而且回到了和渚相遇的坡道前時間也回到了那個時候，這時朋也在想要是當時沒有和渚的相遇就不會發生後來的事情就好了準備故意避開渚。但是後來朋也想起少女的那聲“爸爸”，還是和渚邂逅的然後結婚生孩子，按理說這時候渚會死去但是由於在第一次渚死後，朋也理解了他的父親和渚父親的理解，還有伊吹風子的光玉，收集齊了了CLANNAD中所有光玉（理解為人沒對美好生活得幸福憧憬的結晶，可以引發奇蹟的東西就可以）渚沒有死最後，朋也渚和汐3個人幸福的生活在一起。　　故事最後交代了朋也和父親的和解最後帶汐去看朋也得祖母等事情　　【大結局就是這樣的、如果還有疑問可以再追問我】