目前市場上的酸奶有兩大類：

一是純天然發酵型酸奶；二是配製型酸奶，即在第一種酸奶的基礎上加入食用調味劑的調味酸奶。市售酸奶中的乳酸菌，一般含有“保加利亞乳桿菌”、“嗜酸乳桿菌”、“雙岐桿菌”、“嗜熱鏈球菌”。

“雙岐乳酸桿菌”，是在乳酸桿菌中添加了以低聚果糖或異麥芽糖為主的雙歧因子，這兩種東西可以讓菌群更快繁殖，除此以外並無其它功能。

益生菌是活的微生物，當攝入充足的數量時，對宿主產生健康益處。

因此，酸奶中只有少數菌可能 到達腸道，另外，酸奶所用的菌種是不能定殖在腸道上，屬於“非腸道定殖菌株”。

益生菌粉中所用的菌種都是經過嚴格的安全性評價(例如，抗酸、鹼能力，腸胃道定殖能力)篩 選，菌種經過冷凍乾燥後處於“休眠”狀態，到達腸道後“甦醒”，定殖在腸道上，發揮調節腸道 菌群平衡和啟用抗體的作用。

另外，酸奶都是液態的，益生菌粉都是固態顆粒狀的。國家衛生部2001年3月23日《益生菌 類保健食品評審規定》第十條規定：不提倡以液態形式生產益生菌類保健食品活菌產品。

喝酸奶可以補充益生菌，但酸奶的益生菌是有限的，而且會隨著儲存時間的增加，不斷減少活性。此外每個菌株的耐胃酸、耐膽汁的能力不同，這會影響益生菌能否順利到達腸道發揮作用。相對而言，服用專業的益生菌補充劑是更好的一個選擇。