美國駐日本佐世保海軍基地：

位於九州島西北角，佔地405公頃。該基地系美海軍第11兩棲艦艇中隊和6艘艦船的母港，是美國在日第二大海軍基地，美在海外唯一可常年部署兩棲艦艇部隊的基地，攻擊型兩棲艦艇的出擊基地，也是美軍前沿部署部隊的主要後勤保障基地。　　

美國駐日本厚木海軍航空基地：　　

位於東京西南35公里，佔地486公頃，是美在西太平洋最大的海軍航空設施，駐有美第5航母戰鬥機聯隊，裝備有 F-14戰鬥機和 F/A-18戰鬥攻擊機。

美國駐日本沖繩基地群：　　

沖繩地處東亞海上交通要衝，駐有2.5萬美軍，佔駐日美軍數量的大半。 沖繩群島上的美海軍陸戰隊基地有普天間機場和巴特勒兵營。　　

美國駐日本空日本橫田空軍基地：

　該基地系駐日美軍司令部駐地，現有3600名空軍人員，駐有空軍第5航空隊司令部、第374客運聯隊，裝備了C-130型運輸機，機場跑道長3355米。　　

美國駐日本沖繩嘉手納基地：

該基地位於沖繩島西南部，是美國在遠東地區最大的空軍基地，面積近20平方公里，駐紮該基地部隊主要是美空軍老資格的第5航空隊第18航空聯隊，部署有3個F15戰鬥機中隊、1個預警機中隊和8架KC-135空中加油機，現有軍事人員9000多人。該基地強化了美軍的全球快速反應能力。

美國駐日本三澤基地：　　

位於東京東北644公里，有3600名空軍現役人員，駐有美空軍第35戰鬥機聯隊、海軍海上巡邏機中隊和美軍情報分隊。主要裝備F16戰鬥機、P3型反潛巡邏機，機場跑道長3050米。三澤基地的F16戰鬥機部隊是一支以“打擊對方防空體系”為主要任務的部隊。它的任務是在世界所有發生糾紛的地區首先攻擊敵人的防空體系。