學校恐懼症是透過明顯的焦慮和軀體症狀的結合而體現出來的對上學的非理性的緊張和恐懼。從專業角度來看，學校恐懼症並非真正的恐懼。因此，也可稱為學校拒斥，其病理根源，實際上往往深深地植根於病態的母子關係。往往由於母親需要保持對孩子持續的依戀，而使孩子正常的獨立性發展中斷。 只要上學的壓力不存在，孩子的一切症狀全消，因為正是學校成為孩子向之投射衝突的外部場所。有時候，軀體的一些小毛病會加劇這種恐懼。大部分患有學校恐懼症的少年兒童都有些神經症的特徵，但程度較輕，而社會適應較差，其中有少數人屬於整個人格的扭曲（即人格障礙），他們往往是稍稍大一些的少年。這類孩子往往更加依賴母親，社會適應更不成熟。 這些少年兒童的學校恐懼往往在不知不覺中發生，因為他們本來就是因一些莫名其妙的病而長期缺課者。患學校恐懼症的孩子越早回到學校，並堅持下去，則預後越好。持續不到校，會加劇並固化病理心理。並且，病兒因為從恐懼症中得到額外的好處（例如和母親在一起，獲得物品等），而使病理心理過程被強化。 處理學校恐懼症的第一個步驟，是使孩子儘早回到學校，開始時應先對孩子及家庭進行適當的測評，以確定孩子是否能夠回到學校（往往是能夠的），同時確定孩子及家庭環境中有哪些因素阻撓孩子回到學校，哪些力量能夠支援孩子回去。要告訴孩子及家長，無法上學是情緒障礙的一種症狀，而治療的關鍵是立即回到學校去。在此之後的治療措施則各不相同。有些諮詢師僅僅通知父母，讓他們自己相處切實可行的辦法，以實現孩子回到學校的目標，然後每週數次對孩子及父母進行心理治療，確定並解決回校後遇到的種種困難。 學校恐懼症的治療具體方法： 一是支援性心理療法：對患者加以疏導、鼓勵，耐心地詢問患兒的擔心與焦慮，向他做出解釋和指導，設法改善環境條件（如換一個學校或換一個老師）。 二是家庭治療法：改變過於溺愛孩子的教育方式，與孩子進行更多的感情交流。對於家長本身心理存在問題的，則要追根溯源，雙方同治。 三是系統脫敏療法：家長和學校積極配合，有計劃地使孩子減輕對學校的恐懼心理。開始的時候，每天讓孩子在學校的時間短一點，之後逐漸延長。在治療過程中，老師和同學要多關心、支援、鼓勵，因為這些孩子一般都比較敏感，要注意掌握好度。 四是暴露療法：孩子害怕去學校，偏偏採取一切辦法強制他留在學校，看到日久沒有指望了，他也漸漸調整了心態。這種辦法特別適用於剛上學不久的小朋友，具有強刺激性，但要注意配套的安全措施 博主張雲的話：上述所提供的方法，只是心理諮詢人員和心理輔導人員一貫採用的方法．具體的案例還需要具體的操作．比較適合於輕度的型別，對於嚴重的學校恐懼症，出現了神經症的早期症狀，需要求助於精神病院，進行藥物療法的治療，等病情穩定下來之後，再進行心理疏導．一般需要的週期很長，治療的效果不會很快見效．需要更多的耐心和支援．