康熙的親生母親是孝康章皇后（慈和皇太后）。順治十一年三月十八日（1654年5月4日），玄燁生於北京紫禁城景仁宮，其母孝康章皇后佟佳氏時為庶妃。史載孝康章皇后向太后問安之時，出門時看到有龍繞身，孝莊太后才知道孝康章皇后有身孕。玄燁一出世，就得到了年輕的父母的喜歡，順治帝特委託可靠的奶媽帶他到紫禁城外哺養。孝康章皇后，康熙生母，漢族，本姓佟，隸漢軍正藍旗，康熙即位之後，抬旗進入滿族鑲黃旗，是清朝抬旗第一人。擴充套件資料孝康章皇后，生於崇德五年，佟圖賴之女，順治帝妃嬪，康熙帝生母。清代首位佟佳氏皇后（追尊）。順治十年（1653年）入宮為庶妃。順治十一年（1654年）三月，生皇三子玄燁，15歲。順治十八年（1661年）正月，清世祖福臨駕崩，遺詔中立皇三子玄燁為皇太子繼皇帝位，是為康熙皇帝。康熙元年（1662年）十月，與孝惠章皇后並尊為皇太后，稱聖母皇太后，上徽號曰慈和皇太后。康熙二年（1663年）二月十一日崩，24歲。五月，上尊諡曰孝康慈和莊懿恭惠崇天育聖皇后。六月初六日，合葬孝陵。九年五月，升祔太廟，於尊諡上加稱章皇后。雍正元年八月，加上溫穆二字。乾隆元年三月，加上端靖二字，最終諡號為：孝康慈和莊懿恭惠溫穆端靖崇天育聖章皇后。康熙八年（1669年），康熙為了抬高母家出身，把母家（佟養正這支）由漢軍正藍旗抬到漢軍鑲黃旗，後來又在康熙二十七年再抬至滿洲鑲黃旗。

康熙的母親是佟妃，即孝康章皇后佟佳氏。孝康章皇后（1640年—1663年），佟佳氏，少保、固山額真佟圖賴之女，順治帝愛新覺羅·福臨的妃子，康熙帝愛新覺羅·玄燁的生母，初入宮時為庶妃，及順治帝崩，其子玄燁繼位後與孝惠章皇后並尊為皇太后，稱聖母皇太后，上徽號曰慈和皇太后，康熙二年崩，享年24歲。及崩，葬孝陵，上諡。雍正、乾隆累加諡，諡曰孝康慈和莊懿恭惠溫穆端靖崇文育聖章皇后。後家佟氏，本漢軍，上命改佟佳氏，入滿洲。

清世祖順治帝妃，佟佳氏，都統佟圖賴之女。本姓佟，後改姓佟佳氏。順治初年入宮，為庶妃。1660年，清世祖福臨駕崩，孝莊文皇后冊立佟佳氏所生玄燁為皇帝，即康熙皇帝。佟佳氏被尊為慈和皇太后。2年後，體弱多病的皇太后駕崩於慈寧宮。

佟佳氏先於董鄂氏進宮，順治十年生皇三子玄燁，後董鄂妃入宮，佟佳氏在宮中像當時所有嬪妃一樣，受到皇帝的冷落。按照宮廷的規矩，皇子不能由生母撫養，因此佟佳氏可謂既得不到愛，又無從把愛付出。順治死後2年，身心備受折磨的皇太后因為重病撒手人寰，時年二十四歲。康熙二年（1663年）六月，佟佳氏與孝獻皇后董鄂氏和世祖福臨合葬清孝陵，雍正、乾隆朝累加諡，諡號為：孝康慈和莊懿恭惠溫穆端靖崇文育聖章皇后。