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1 # 司大勇
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2 # 2分鐘看世界
近日,
一篇英國和德國學者共同撰寫的論文,
在中國的網路上引起了圍觀。
研究人員發現,
在人類中最早出現的原始版本的新冠病毒“A型”,
雖然出現在武漢,
但並沒有在武漢流行開來,
而是在美國更為常見。
這篇科研論文,
目前已經發布在了,
國際知名的學術期刊《美國科學院院報》(PNAS)上。
論文的第一作者為英國劍橋大學的Peter Forster博士。
把從“全球共享流感資料倡議組織”(GISAID)
的資料庫中提取的160個世界各地的新冠病毒基因,
按照進化的關係,
分為了A、B、C三個型別。
其中,
與蝙蝠身上的那種冠狀病毒,
最為接近的是A型新冠病毒,
這也被研究人員認定為,
是在人類身上傳播的新冠病毒的“原始”型別。
令研究人員意外的是,
這種A型的新冠病毒,
雖然出現在了武漢,
並感染了5名武漢人,
在4名廣東病例身上也有發現,
但在武漢、中國乃至東亞地區被更多發現的,
卻是這種A型新冠病毒的變異版,
即B型新冠病毒。
而A型的病毒,
則被更多地發現於美國和澳洲的病例中,
其中早期的美國病例有在武漢居住旅行的歷史。
換言之,
從這篇研究來看,
最原始的A型新冠病毒,
雖然出現在武漢,
但並沒有在當地流傳開,
反倒是由A型變異而來的B型在武漢傳播了開來,
進而傳播到了中國其他地方以及東亞多個地方。
而A型真正擴散開來的地方,
目前看來是美國和澳洲。
流傳於歐洲的C型,
則是由在中國和東亞擴散開來的B型變異過去的。
跟西班牙流感的變異路徑類似,
源於美國,
出口轉內銷,
回到美國,
大爆發
2019-2020 湖北省武漢市野味市場新肺炎疫情發生之後,2020年1月8日,確認了新型冠狀病毒為此次疫情的病原,2020年1月10日開始,陸續公佈了新肺炎病原體基因組序列。
現在只是病毒傳播的初期,該病毒未來的致死風險會有多大?人傳人的傳染性會有多強?會不會快速變異成為高傳染性高致死率的超級病毒?
為了初步解答這個問題,筆者在專業病毒資料庫GISAID中,下載了已經公佈的26株新肺炎病原體的基因組序列,分析看看這些病毒是否出現了快速變異。
20多株病毒的序列差異比較圖。
分析結果如圖所示,可見,和最開始發現的幾個病毒序列相比,其他病毒序列高度相似。在病毒的整個3萬鹼基中,有的病毒有一個鹼基有變異,有的病毒有兩個鹼基發生了變異,還有的病毒有三個鹼基發生了突變,而更多的病毒沒有發生任何突變。