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DNA聚合酶(DNA polymerase)是細胞複製DNA的重要作用酶。
DNA聚合酶 , 以DNA為複製模板,從將DNA由5"端點開始複製到3"端的酶。
DNA聚合酶的主要活性是催化DNA的合成(在具備模板、 引物、dNTP 等的情況下)及其相輔的活性。
功能[1] 聚合作用:在引物RNA"-OH末端,以dNTP為底物,按模板DNA上的指令由DNApolⅠ逐個將核苷酸
[2]3"→5"外切酶活性──校對作用:這種酶活性的主要功能是從3"→5"方向識別和切除不配對的DNA 生長鏈末端的核苷酸。
[3]5"→3"外切酶活性── 切除修復作用:5"→3"外切酶活性就是從5"→3"方向水解DNA 生長鏈前方的DNA鏈,主要產生5"- 脫氧核苷酸。
[4] 焦磷酸解作用:DNApolⅠ的這種活性可以催化3"末端 焦磷酸解DNA分子。這種作用就是無機焦磷酸分解DNA 生長鏈,可以認為是DNA聚合作用的逆反應,而且這種水解DNA鏈作用需要有模板DNA的存在。(dNMP)n+XPPi←(dNMP)n-x+X(dNPPP)→DNA
[5]焦磷酸交換作用:催化dNTP末端的PPi同無機焦磷酸的交換反應。反應式為32P32Pi+dNPPP←dNP32P32P+PPi→DNA
什麼是DNA聚合酶
DNA聚合酶,又稱DNA依賴的DNA聚合酶(DNA—dependent DNA polymerase,DNA pol),它是以親代DNA為模板,催化底物dNTP分子聚合形成子代DNA的一類酶。此酶最早是美國科學家Arthur Komberg於1957年在大腸桿菌中發現的,被稱為DNA聚合酶Ⅰ(DNA polymerase Ⅰ,簡稱polⅠ)以後陸續在其他原核生物及真核生物中找到了多種DNA聚合酶。這些DNA聚合酶的共同特徵為:①具有5’→3’聚合酶活性,這就決定了DNA只能沿著5’→3’方向合成;②需要引物,DNA聚合酶不能催化DNA新鏈從頭合成,只能催化dNTP加入核苷酸鏈的3"-OH末端。因而複製之初需要一段DNA引物的3’一OH端為起點,合成5’→3’方向的新鏈。
DNA聚合酶的應用E.coli的DNA pol Ⅰ涉及DNA損傷修復,在半保留複製中起輔助的作用。DNA polⅡ在修復損傷中也具有重要的作用。DNA polⅢ是一種多亞基的蛋白質,在DNA新鏈的從頭合成中起復制酶的作用。
複製的忠實性問題會影響到翻譯的精確性,這種忠實性主要依賴於鹼基的特異性配對。據估計每個鹼基對將有10-3。的機率會發生錯配,但實際的錯配率只有10-8~10-10,即每1000個細菌複製週期中,每個基因組只產生一次錯誤。DNA多聚酶能增加互補鹼基的特異性,該特異性主要表現在以下兩方面:
①能夠檢查進入的鹼基是否和模板互補,這時透過一個匹配的化學特點加以識別,這是合成前的一種預防措施,稱為合成前( presynthetic)錯誤控制;
②在新的鹼基加到鏈上以後,檢查鹼基是否配對。若發生錯配,將會把剛加上去的錯誤鹼基切除掉,這是校正控制( proofreading)。
細菌的三種DNA聚合酶都具有3 7硝’外切活性,逆DNA合成方向進行加工,提供校對功能。在鏈的延伸階段中,一個核苷酸進人生長鏈的末端,形成鍵,該酶就向前移一個鹼基對,準備下一個鹼基對的進入。若一個錯誤產生了,這個酶就向回退,切除最後加進來的這個鹼基,產生一個位點,然後被正確的鹼基取代。
不同DNA多聚酶聚合和校正之間的關係是不同的。有時,這些活性是由相同的蛋白質亞基產生的,但有時它們又還有不同的亞基。一個錯誤鹼基的排除實際上是十分複雜的,因為這種切除反應是由不同位點催化的。