根據秸稈發酵全過程，需要另加兩三樣東西后，共同發酵後效果更佳。方法是先將地面挖N×N米的坑，將秸稈覆一層，大約十歷米厚，然後把人糞尿或畜糞便在上面倒上一層，以秸稈溼透最好；後覆土蓋上秸稈和糞便，最後用EM菌劑嘖灑土表面即可。這樣一層比一層小一點，反覆幾層後收頂，用麥草泥封嚴實後覆膜半年。一堆生物有機肥高溫發酵成功，然後拌勻後使用，效果及佳。

秸稈發酵後看是拿來做什麼用。一個是用來做有機肥，一個可以用來做飼料。做有機肥裡面可拌進入25%左右的動物糞便，水分控制在50%左右，然後然後優菌康有機肥發酵劑菌種，一起打堆發酵，期間翻堆3-4次即可。而做飼料用需要新增5-10%的玉米粉或者麥麩，將水分控制在50-60%，拌進生態寶飼料發酵劑或者菌寶貝飼料發酵劑，然後密封發酵2-3天即可使用，飼餵量為30-60%。

用秸稈發酵辦法，產生二氧化碳，在中國北方正在推廣，不僅提供作物二氧化碳，還能使大棚產生熱量、有機肥料，提高作物抗性是一項提高作物產量和品質的新技術。據測定，用秸稈發酵，可是大棚內的二氧化碳濃度提高到0.1％，黃瓜增產42％，芹菜增加產量50％。秸杆發酵除了產生二氧化碳外，也有其他有害廢氣，如硫化氫，二氧化硫等，可以用脫硫裝置排除。

秸稈發酵腐熟要比平常用的綠肥類、碎草類、枯枝爛葉類、動物殘骸類要困難一些，主要是體積大、養分低以及纖維素含量過高几方面的問退。我個人感覺秸稈腐熟發酵比較適合大型農業合作社或者企業行為執行。主要有幾下幾點原因。

1、秸稈還田易引發一些副作用。在北方地區由於冬季時間較長，秸稈在土壤中腐爛困難。其自身帶走的病菌和蟲卵易對下茬作物產生危害；其次，秸稈腐熟需要人為的在耕地裡施用氮肥來加速其腐爛，無形之中增加了成本。

2、農戶的機械力量有限。國內農戶的機械多以中小型機械為主，而一般情況下秸稈打捆都是打捆，農戶沒有合適的機械將其運輸至田地外，只能是僱傭小型叉車或者剷車作業。但是這樣有一個侷限就是小型車輛在水田中行走有困難，效率太低。

3、堆肥場所。秸稈腐熟最好的方式是粉碎成粉末狀，但是農戶沒有能力再去購置適合這種作業的機械，且秸稈量比較大也沒有足夠的場所去堆制秸稈製作有機肥。而大型農業合作社的資金較為雄厚且機型多樣、有能力來準備一個適合堆制秸稈有機肥的場所。

因此，我建議大型農業合作社可以採取將秸稈粉碎與糞便及其他適合製作有機肥的材料混合堆制有機肥。並且可以在腐熟後加入一些有益微生物和微量元素，再重新施入耕地培肥地力並且補充土壤的微量元素和創造一個有益微生物種群較為強大的微生物環境，來抑制土壤中的有害微生物和病菌的數量和繁殖能力。