生物醫學工程專業的就業前景很好，畢業生的主要就業方向為管理機構和國家機關、醫學機構、國際製藥、保健品企業等。生物醫學工程專業學生就業的主要去向為研究機構，醫院影像、裝置、臨床工程、資訊中心等相關科室，醫療器械相關企業、事業單位，政府相關管理部門等。畢業生工作去向主要有以下幾個方向：醫院，到醫院裝置科，放射科，資訊中心等部門工作，主要從事醫療器械的維護、採購管理工作以及資訊管理等；醫療器械企業，到醫療儀器企業做研發、銷售、維修。銷售主要是做好本區域內老客戶的器械更新等業務，同時需要開發新的銷售渠道；售後工程師，主要負責所屬器械的安裝除錯維修等。醫療器械企業南方發展普遍較好，企業多，就業機會多；電子計算機相關企業。生物醫學工程專業所學知識面廣，包括很多電子計算機方面的課程，很多畢業生進入此類企業工作；高等醫學院校從事醫學影像技術的教學、科研工作；報考相關方向的公務員；除此之外，應徵入伍、參加支援西部計劃、到村任職、報考選調生、自主創業等就業途徑。

可在管理機構和國家機關，醫學機構（臨床研究、高度專業化的醫學護理，管理）,在醫療器械的使用、銷售和服務上，研究所，大學（基礎研究，教學），國際製藥、保健品企業（管理、研究和開發），私人機構和醫生合作，畢業生可直接參加高度專業化的醫學護理和解決臨床基礎研究的問題，由他們研製的器械和系統對於疾病的觀察、診斷、治療、緩解起著很重要的作用。

生物醫學工程就業工作方向：

第一，讀研究生繼續深造。如果想在這一領域搞科研，或有更深入的發展就要繼續深造。撇開別的不說，進大學和科研院所的門檻基本都是博士，本科階段的學習只是個基礎。

第二，進入國家醫療器械司及各級醫療器械檢測所。

第三，各級醫院的醫學工程處、裝置處、資訊中心以及醫學影像科也是畢業生非常願意去的地方。這些地方工作穩定大多屬於事業單位，競爭壓力也是比較大的。

第四，去各大跨國以及國內醫療器械企業，另外，就是各類醫療器械代理公司。