溶洞中的美麗鐘乳石景觀在岩溶學上被稱為次生化學沉積物（speleothems）,這類沉積物是因雨水溶解了石頭中的碳酸鹽，並透過巖洞中的縫隙到達洞穴空間，這種含有重碳酸鈣的水溶液在氧氣不是很充分的條件下，由於物理化學條件的變化或生物活動的參與，致使水中的重碳酸鈣達到飽和重新析出而形成的。　　含有重碳酸鈣的水溶液透過洞頂的縫隙到達洞頂時，隨著溶液中二氧化碳的溢位以及水分的蒸發，碳酸鈣慢慢析出，析出的碳酸鈣一層一層相互覆蓋，隨著水珠表面的張力和地心引力大小對比的不同而形成石鐘乳和石筍。水珠表面的張力大於地心引力時，析出的碳酸鈣會附著在洞頂並形成一個小乳尖，這樣的小乳尖慢慢地就形成。

溶洞均為碳酸鹽質岩石，十分堅硬，但因長期沉浸在地下水中而被溶解。這樣一年又一年，堅硬的岩層便被溶蝕出一個個洞穴。當溶有石灰質的地下水重新滴入洞中時，由於環境中溫度、壓力的變化，使水中的二氧化碳逸出，於是水對石灰質的溶解力降低，致使原本溶解在水中的部分石灰質因過飽和而沉澱析出，日積月累，便形成了石鐘乳、石筍和石柱。生物建造學認為，藻類在生長髮育過程中會分泌鈣質，能收集、粘接微細的石灰質顆粒，並且常營叢集生活。溶洞中的石鐘乳幾乎都是迎著光線朝上彎曲生長的，這與藻類的趨光生長的特性相吻合。石鐘乳、石筍內部還有像樹木年輪一般的同心圓狀構造，這又是藻類生物逐年生長、分泌、收集和粘接石灰質微粒的結果。綜上所述，生物建造學認為，雖然溶洞的洞穴空間的形成與水的溶蝕作用有關，但溶洞中石鐘乳、石筍和石柱的形成，則應該主要是藻類生物在漫長的地質歲月中逐漸建造起來的，經過的石化作用，才呈現出今天的面貌。