題主所問的:“所有原子裡的質子都是一樣的嗎？”是想問質子的表徵都是不是一樣的吧？

我們都知道，原子核中的質子數決定了原子屬於什麼元素；電子雲中的電子數（與質子數相同）決定了原子及元素的化學性質。一些原子相互之間具有相同的電子數或質子數，但具有不同數目的中子，所形成的化學元素稱為同位素。

也就是說，物質的基本表徵體現於原子核中的質子數，而不是質子本身所呈現不同的表徵所致。在當前科學水平認知中，所有原子中的質子都是一樣的。再往下細分效能區別，已經超出觀測極限。（即便還有夸克等更細化的量子概念，但分辨不出效能區別。物質的效能區分最小量化單位到原子）

繼續探討:“可以透過改變原子中的質子數改變元素，繼而改造物質嗎？”

理論上當然可以，但是實際操作成本太高。

要改造物質基本只需要透過外部條件:溫度、壓力、運動速度等改變元素排列就可以了。對單個原子中的質子數干預改變，只適合實驗觀測，無法達到整體顯現效果。因為任何物質所含原子數都極多，要統一改變某一序列的原子中的質子數，不符合實際適用需求。

核裂變和核聚變都是原子核的對撞產生的鏈式反應。目前還不能針對海量原子核中的質子（撇開中子的作用）作出統一干預手段。

題目不夠嚴謹，氫原子是由1個質子和1個電子構成的，不存在中子，所以原子也可以只由質子和電子構成。所以原子裡的質子是不是一樣呢？看你要不要考慮量子理論和絃理論等。如果簡單認為質子是不可分的粒子了，注意這裡是假設的，那麼可以粗略認為所有原子裡的質子都是一樣的。如果考慮質子還可再分，如夸克是組成質子的一部分，那麼質子就不一定是完全一樣的了，不過這種差異超越了現有任何探測器的能力，可以忽略不計。此段分析不太肯定，只是按我的理解來說是這樣，希望有大神在評論裡指點一下。關於改變原子裡的質子來改變原子種類，這就是常說的核反應啊，不過沒有那麼容易實現的。人類還很難輕鬆的往原子里加減幾個質子，現在的核聚變和核裂變可是要用很高科技的裝置才能實現的。

核聚變可得到增加了質子的新原子。核裂變可以得到減少質子的新原子。核聚變和核裂變就不說了，參考質能方程，現在的人類哪怕知道此方程，有些原子也是很難得到的。看看元素週期表裡面的人造元素有幾個，又有多難被發現或製造出來，就知道改變原子內的質子數有多難了吧。

不是的！質子和中子是同一種物質的兩種不同狀態，它們也可以透過躍遷來進行相互間的轉化，如同原子核躍遷會放出伽馬光子，質子中子之間的躍遷也會放出電子這些物質。而電子則完全不同於中子和質子。

原子由質子、中子和核外電子組成，質子和中子又組成了原子核！

電子，即核外電子（e）,是繞原子核高速運轉的粒子,它的排布是分層的(一圈圈的),它的最外層電子個數決定著該原子的化學性質.它的質量是9.11×10-31kg。

原子核由質子和中子組成，質子的質量大約為1.672621637（83）×10-27kg，大約是電子質量的1836.5倍；而中子的質量比質子質量稍微重一點1.674927211（84）×10-27kg。這是因為質子帶正電，中子成中性，即質子相比於中子少了電子的質量。一般來說，這個質量可以忽略不計，認為質子和中子質量一樣，都等於一個H原子的質量為1。所以一般認為原子的質量就是質子和中子的質量之後，忽略其中電子的質量！