複合肥是否適於和有機肥混合，需要根據混合肥裡所含的元素而定。很多人認為化肥的肥力不夠就隨意搭配有機肥，其實化肥和有機肥不是可以任意混合的。有些混合後能提高肥效，有些則反而降低肥效。可以與有機肥混合的：鈣鎂磷肥、磷礦粉與廄肥、堆肥混合，由於堆肥發酵產生各種有機酸，可以促使鈣鎂磷肥中的磷溶解，因而可以提高磷肥效果；過磷酸鈣與廄肥、堆肥混合施用，還可以減少磷的固定；泥炭等有機肥與草木灰、鋼渣磷肥等鹼性肥混合後，可以相互中和並相互提高肥效；人糞尿中混以少量過磷酸鈣，可形成磷酸二氫銨，減少氨的揮發損失。不宜和有機肥混合的：含硝態氮的化肥與未腐熟的堆肥、廄肥或新鮮秸稈堆制，由於反硝化作用，易引起氮素損失；新鮮秸稈類肥料與化學氮肥混合施用，會因微生物的大量繁殖，其中氮大都已轉化成銨態氮，不宜再與鹼性肥料混合，否則會使氮揮發損失。

　　化肥與生物有機肥混合施用的好處有：

　　 ⑴、提高化肥的肥效。如過磷酸鈣等施入土壤後易被土壤固定而失效，與生物有機肥混合後施用，減少了化肥與土壤的接觸面，減少養分的固定，同時化肥也可以被生物有機肥吸收保蓄，減少養分流失。

　　⑵、減少化肥施用後可能產生的某些副作用。單獨施用較大量化肥或化肥施用不均勻時，容易對作物產生毒副作用，如長期施用生理酸性肥料，會使土壤變酸，產生過多的活性鐵、活性鋁等有毒物質，如過多遊離酸的過磷酸鈣，作種肥時會影響種子發芽和幼苗生長，若與生物有機肥混合後施用，則不會發生此類問題。

　　 ⑶、增加作物養分。化肥只能為作物提供一種或幾種養分，長期施用，作物會產生缺素症。生物有機肥所含養分全面，肥效穩而長，含有大量的有益微生物和有機質，能夠改善土壤理化性質和微生物區系，增強土壤中酶的活性，有利於養分轉化。