一、兩者之間根本區別就在於轉基因大豆裡面含有非自身物種攜帶的DNA。這種基因改變目前體現出來的優勢是：轉基因產品產量高50%~100%，抗病蟲害（蟲子吃了會因蛋白質不消化及可能引起的異常凝結而死亡），蛋白質和脂肪含量總和遠遠高於非轉基因物種。劣勢是：轉基因大豆對土壤的耗用遠遠大於非轉基因大豆，需要輪休耕種。

二、國際上主流科學研究認為目前尚未發現轉基因植物食品對人體有害，但由於這類食物應用時間還比較短，長期效果如何，長期食用是否對人體有害，還不能完全肯定，存在一定的爭議。

三、轉基因產品可能存在的危害：

1、毒性問題。一些研究學者認為，對於基因的人工提煉和新增，可能在達到某些人們想達到的效果的同時，也增加和積聚了食物中原有的微量毒素。

2、過敏反應問題。對於一種食物過敏的人有時還會對一種以前他們不過敏的食物產生過敏。

3、營養問題。科學家們認為外來基因會以一種人們目前還不甚瞭解的方式破壞食物中的營養成分。

4、對抗生素的抵抗作用。當科學家把一個外來基因加入到植物或細菌中去，這個基因會與別的基因連線在一起。人們在服用了這種改良食物後，食物會在人體內將抗藥性基因傳給致病的細菌，使人體產生抗藥性。

5、對環境的威脅。在許多基因改良品種中包含有從桿菌中提取出來的細菌基因，這種基因會產生一種對昆蟲和害蟲有毒的蛋白質，生態學家們認為那些不在改良範圍之內的其它物種有可能成為改良物種的受害者，生物學家們則擔心為了培養一些更具優良特性，其特性很可能會透過花粉等媒介傳播給野生物種。

最後，不得不說明的是：轉基因食品是否對人體有害，目前學術界尚無定論，到目前為止也暫沒曾出現過因食用轉基因食品而導致的不適證。