抗生素的危害有：細菌耐藥，破壞腸道菌群，影響人體的免疫系統。
一、細菌耐藥抗生素本來就是消滅細菌的，但是在殺滅或抑制過程中，細菌也一直在“反抗”，濫用抗生素會導致細菌耐藥，最後導致無藥可用。
二、破壞腸道菌群服用抗生素的同時，腸道菌群無論是有益菌，還是有害菌均會被破壞。抗生素藥物每使用一次，對腸道菌群能夠造成非常大的破壞，甚至需要數年才能恢復。嚴重的菌群失調可以導致機體出現一系列臨床症狀，主要見於長期應用廣譜抗生素治療的患者，其體內對抗生素敏感的細菌被大量殺滅，而不敏感的細菌，如金葡菌、白色念珠菌等則乘機繁殖，引起假膜性腸炎、白色念珠菌性肺炎等，也就是臨床上所謂的二重感染，進而給疾病的治療帶來很大的麻煩，產生嚴重的不良後果。
三、影響人體的免疫系統人體有超過 80% 的免疫功能建構在腸道中的益生菌平衡上，從嬰兒開始，腸道菌群便逐漸發揮作用，免疫功能也由此啟動。抗生素的濫用嚴重影響腸道菌群的平衡，摧毀大量的益生菌，影響人體的免疫系統，使得我們更加容易生病。抗生素在殺滅病原菌的同時也會對人體造成損害。藥物經口腔入胃、經腸道吸收入血輸送到人體的各個細胞中，而只有到達病灶部位的藥物才對病原菌能起到殺菌的作用，其它組織中的藥物不但沒有起到殺菌的作用，反而代謝產物要經肝腎排出體外，對肝腎等臟器有一定的損害作用，如氯黴素、林可黴素、四環素、紅黴素等，都需要在肝內代謝。此外，許多抗生素如青黴素、鏈黴素等藥物可引起變態反應，如過敏性休克，從輕微皮疹、發熱到造血系統抑制等，甚至也會損害神經系統，如中樞神經系統、聽力、視力、周圍神經系統病變以及神經肌肉傳導阻滯作用等。抗生素的濫用也有可能引起菌群的失調、延誤疾病的治療。由於受到抗生素的影響，正常菌群中各種細菌的種類和數量都會發生變化。
抗生素的危害有：細菌耐藥，破壞腸道菌群，影響人體的免疫系統。
一、細菌耐藥抗生素本來就是消滅細菌的，但是在殺滅或抑制過程中，細菌也一直在“反抗”，濫用抗生素會導致細菌耐藥，最後導致無藥可用。
二、破壞腸道菌群服用抗生素的同時，腸道菌群無論是有益菌，還是有害菌均會被破壞。抗生素藥物每使用一次，對腸道菌群能夠造成非常大的破壞，甚至需要數年才能恢復。嚴重的菌群失調可以導致機體出現一系列臨床症狀，主要見於長期應用廣譜抗生素治療的患者，其體內對抗生素敏感的細菌被大量殺滅，而不敏感的細菌，如金葡菌、白色念珠菌等則乘機繁殖，引起假膜性腸炎、白色念珠菌性肺炎等，也就是臨床上所謂的二重感染，進而給疾病的治療帶來很大的麻煩，產生嚴重的不良後果。
三、影響人體的免疫系統人體有超過 80% 的免疫功能建構在腸道中的益生菌平衡上，從嬰兒開始，腸道菌群便逐漸發揮作用，免疫功能也由此啟動。抗生素的濫用嚴重影響腸道菌群的平衡，摧毀大量的益生菌，影響人體的免疫系統，使得我們更加容易生病。抗生素在殺滅病原菌的同時也會對人體造成損害。藥物經口腔入胃、經腸道吸收入血輸送到人體的各個細胞中，而只有到達病灶部位的藥物才對病原菌能起到殺菌的作用，其它組織中的藥物不但沒有起到殺菌的作用，反而代謝產物要經肝腎排出體外，對肝腎等臟器有一定的損害作用，如氯黴素、林可黴素、四環素、紅黴素等，都需要在肝內代謝。此外，許多抗生素如青黴素、鏈黴素等藥物可引起變態反應，如過敏性休克，從輕微皮疹、發熱到造血系統抑制等，甚至也會損害神經系統，如中樞神經系統、聽力、視力、周圍神經系統病變以及神經肌肉傳導阻滯作用等。抗生素的濫用也有可能引起菌群的失調、延誤疾病的治療。由於受到抗生素的影響，正常菌群中各種細菌的種類和數量都會發生變化。