菌袋上佈滿豆油樣的菌苔：發生原因培養料含水量大，透氣性差，引起酵母菌大量滋生，在袋膜上大量積聚，形成豆腐渣樣菌佈滿袋壁料內出現發酵酸味，影響菌絲繼續生長。此種情況尤以玉米芯為培養料時多見。

防治方法：用直徑1釐米的圓木棍削尖頭，從料袋兩頭注中間扎2~3個孔，深5~8釐米，以通氣補氧。隨後不久袋內壁附著的酵母菌苔會逐漸自行消退，平菇菌絲就會繼續生長。

菌絲未滿袋就出菇：發生原因菌種用量過大；菌種太老，老菌塊提前進入了生殖生長，未等菌絲完全發滿就出菇；袋口鬆開過早，菇棚內光線過強或晝夜溫差過大刺激出菇

防治方法：菌種用量控制在12%~15%;選用菌齡適宜的菌種；待菌絲髮滿後，再開啟袋口；注意遮光和夜間保溫改善發菌環境。

菌絲長滿菌袋後不出菇：發生原因品種溫型不適；培養料碳氮比不當，不利營養生長轉入生殖生長；晝夜溫差過小、袋溫形不成5℃以上溫差菇房溼度太低，或不恆定；端面菌皮太厚、太硬；料面氣生菌絲生長過旺，形成了菌皮；害蟲危害。

防治方法根據出菇時間選擇合適的品種；優選栽培料的配方，減少氮源的新增量；高溫時段出菇的菌袋應稀疏排放，把菌袋放熱散發出來；早、晚氣溫低時通風，延長通風時間，人為地拉大晝夜溫差，促使菌絲扭結，形成原基。挖得淺的菇房空氣相對溼度太低，可採取噴水、洇水等辦法提高溼度，使空氣相對溼度保持在85%~95%,保持菇房如同剛降過雨一樣，空氣潮溼而又新鮮。