首先，從作用機制對比：敵敵畏中毒屬於有機磷農藥中毒，主要是有機磷毒物進入體內後迅速與體內的膽鹼酯酶結合，生成磷醯化膽鹼酯酶，使膽鹼酯酶喪失了水解乙醯膽鹼的功能，導致膽鹼能神經遞質大量積聚，作用於膽鹼受體，產生嚴重的神經功能紊亂，特別是呼吸功能障礙，從而影響生命活動。由於副交感神經興奮造成的M樣作用使患者呼吸道大量腺體分泌，造成嚴重的肺水腫，加重了缺氧，患者可因呼吸衰竭和缺氧死亡。百草枯中毒主要是引起肺損傷以及後期出現肺泡內和肺間質纖維化。

其次，從中毒的後果來對比：敵敵畏中毒如果劑量小並且搶救及時的話，那麼病人是完全可以痊癒的，並且愈後狀況良好；如果劑量過大或者搶救不及時，那麼病人會在短期內死亡。而百草枯一旦中毒，迄今為止很少有治癒的。

最後，說一說二者中毒最明顯的區別：敵敵畏中毒的結果無非是生還或短期死去，至少不會像百草枯中毒一樣煎熬。而百草枯中毒一般無法治癒，但是病人不會短期死去。很多案例都是病人一時衝動喝了百草枯，冷靜下來以後雖然後悔了，但是已經來不及了。一旦百草枯被人體吸收了一定的量以後，縱使病人如何的悔不當初，如何的熱愛生活，都改變不了死亡的結局。在這個過程中病人會遭受心理和身體的雙重煎熬：心理上擁有無限的求生慾望卻又不得不等待死亡；身體上隨著病情惡化、肺纖維化加重，病人的呼吸越來越困難，同時還會伴隨著其他器官的衰竭，最後才會死亡。

都說死亡不可怕，可怕的是等待死亡的過程。人的求生慾望越強，等待死亡的過程就越煎熬。從這個意義上來說，百草枯的“毒性”可比敵敵畏強多了。