馬皇后作為朱元璋最愛的一個妃子，在前面生享受非常高的待遇，但是在最後的死亡的時候場景卻是非常的慘烈。因為病重的原因，她拒絕任何的治療方式，最後是活活的被病痛所折磨而死亡，一生榮耀最後的這種去世的方式讓許多人都不為嘆息。

馬皇后在處理每一件事情的時候，都以仁心所相對，朱元璋在前殿處理事情的時候，有時候非常的惱火，但是馬皇后總是能夠說服朱元璋減輕刑罰的人。馬皇后對每個百姓都有著及其善良的心，朱元璋聽不得任何人的讒言，並且對身邊的人都是有著防備之心，一次有人告訴他郭景祥的兒子想要殺他，朱元璋聽后里面傳出指令殺了郭景祥的兒子，辛虧馬皇后在身邊勸阻，這個事情才沒有發生，後來發現果然他是被冤枉的，這不僅讓朝臣更加信服於他，也非常好的處理了郭景祥的兒子被誣陷一事。

1382年(洪武十五年)農曆八月，馬皇后在睡覺的時候得病。群臣請求祈禱祭祀，求取太醫院的良醫診治。馬皇后對朱元璋說：“死生，是命運的安排，祈禱祭祀有什麼用處呢!況且醫生又怎能使人活命!如果吃藥不能見效，恐怕會因為我的緣故而降罪各位醫生吧?”病情加重時，朱元璋問她想說什麼。馬皇后說：“希望陛下能夠求取賢能的人，聽取別人的意見，自始至終，認真對待，子孫都能夠賢能，大臣百姓都能夠有所依靠罷了。” 馬皇后在1382年(洪武十五年)農曆八月丙戌日(八月二十四)去世，享年五十一歲。朱元璋非常傷心，於是從此不再立皇后。