根系由自身體細胞產生的苗木。亦稱無性系苗或營養系苗。由這種苗木成長的果樹稱自根樹。中國早在東漢時期就有壓條繁殖自根苗的記載。至今果樹生產上有些樹種仍用自根苗建立果園，蘋果、梨等的矮化砧木繁殖亦常用自根苗。；自根苗是用優良母株的枝、根、芽等營養器官繁殖而成，是由體細胞繼續分化、生長形成的苗木。它保持了母株的遺傳性，苗木生長整齊一致，很少變異，有利栽培；培育果苗時不用砧木，無須進行嫁接，方法較為簡便。但自根苗的根系不如實生苗發達，易於早衰，其抗性、適應性亦低於實生苗；育苗時需用大量繁殖材料，繁殖係數較低。對於營養器官難以生根的樹種也無法利用自根苗。；自根苗可用扦插、壓條、分株以及組織培養等方法繁殖。葡萄、榲桲、無花果、石榴等果樹常用硬枝扦插；柑橘類果樹可用嫩枝扦插（見扦插繁殖）；龍眼、荔枝常用高空壓條；蘋果矮化砧木採用直立或水平壓條（見壓條繁殖）；銀杏、棗、櫻桃、香蕉、菠蘿、草莓等用分株方法繁殖（見分株繁殖）。；20世紀70年代以來，已能應用組織培養手段大量培育自根苗，並日益受到重視。一些國家對習用嫁接育苗的桃和蘋果開始用品種自根苗建立果園，目前正在試驗中。

春季果樹根生長的營養主要來自土壤中。

當春季土溫達3～4℃以上時，根系開始生長。一般從萌芽前至4月下旬為第一次生長高峰，主要受地溫和貯藏養分制約。這次高峰髮根較多，但生長時間較短。