1.促進消化益生菌能夠幫助我們更好的消化和吸收營養物質，這是因為益生菌株在我們的胃腸道內會產生消化酶，正是這些酶的作用，才能使我們更好地消化攝入的食品。

2.調節腸道菌群平衡活著的益生菌進入人體腸道之後，透過生長和代謝作用來促進腸道中細菌群的正常化，抑制腸道內腐敗物質產生，保持腸道機能正常。能夠有效預防細菌性進行腸炎，痢疾，便秘等症狀。還有一部分益生菌有抗胃酸的功效，益生菌依附在胃壁上皮細胞表面，透過代謝活動來抑制幽門螺桿菌生長，預防胃潰瘍發生。

3.緩解乳糖不耐症益生菌能夠幫助乳糖不耐受者產生半乳糖苷酶活性菌，將乳糖分解成乳酸，從而解決乳糖不耐受者因攝入乳糖而產生的腹痛、脹氣等不良反應。

4.增強人體免疫力攝入益生菌後，活性益生菌可以在腸道內定殖，從而調節腸道各種不同菌群的平衡。益生菌還可以直接對腸道的免疫系統產生影響，增強腸道的免疫功能。

5.降低血清膽固醇益生菌降低血清膽固醇可能與調節利用內源性代謝產物，加速短鏈脂肪酸代謝有關係。服用雙歧桿菌，乳酸桿菌的生物製劑，能夠使膽固醇轉化成人體不會吸收的糞甾醇類物質，來達到降低血清膽固醇的目的。

6.緩解過敏過敏主要是由於人體免疫功能失調出現不平衡的現象。當過敏體質的人群受到外來物質或生物體刺激免疫系統，產生過多免疫球蛋白，釋放出一種叫組織胺的物質，從而引發過敏症狀。益生菌能起到調節體內免疫球蛋白抗體，有效緩解過敏症狀的功效。