雲計算應用的現存問題主要有以下幾點：

1.虛擬化安全問題：如果物理主機受到破壞，其所管理的虛擬伺服器由於存在和物理主機的交流，有可能被攻克，若物理主機和虛擬機器不交流，則可能存在虛擬機器逃逸。如果物理主機上的虛擬網路受到破壞，由於存在物理主機和虛擬機器的交流，以及一臺虛擬機器監控另一臺虛擬機器的場景，導致虛擬機器也會受到損害。

2.資料集中的安全問題：使用者的資料儲存、處理、網路傳輸等都與雲計算系統有關，包括如何有效儲存資料以避免資料丟失或損壞，如何對多租戶應用進行資料隔離，如何避免資料服務被阻塞等等。

3.雲平臺可用性問題：使用者的資料和業務應用處於雲平臺遭受攻擊的問題系統中，其業務流程將依賴於雲平臺服務連續性、SLA和IT流程、安全策略、事件處理和分析等提出了挑戰。另外，當發生系統故障時，如何保證使用者資料的快速恢復也成為一個重要問題。

4.雲平臺遭受攻擊的問題：雲計算平臺由於其使用者、資訊資源的高度集中，容易成為駭客攻擊的目標，由此拒絕服務造成的後果和破壞性將會明顯超過傳統的企業網應用環境。

5.法律風險：雲計算應用地域弱、資訊流動性大，資訊服務或使用者資料可能分佈在不同地區甚至是不同國家，在政府資訊保安監管等方面存在法律差異與糾紛;同時由於虛擬化等技術引起的使用者間物理界限模糊可能導致的司法取證問題也不容忽視。