由微生物引起的植物病害具有重要的生態學及重大的經濟意義。能寄生於植物的病毒、細菌、真菌和原生動物都屬於植物病原微生物。在輕微條件下它們只引起植物生長的失調並降低其在生態環境中的生活和競爭能力；嚴重時則會導致植物死亡、大幅度減產和饑荒。病原微生物與植物的相互關係有一定的專一性。不同病原菌的寄主範圍寬窄不同，有些病原菌只危害一種或少數幾種植物，另一些病原菌的專一性較低，它們常能寄生於多種不同的植物。有些病原菌除了寄生以外，在沒有適合的寄主時，還能營腐生生活，它們屬於兼性寄生的類群。在植物體內大量發展的病原菌透過各種途徑干擾植物的正常功能並引起病害的典型症狀。例如，植物葉組織壞死造成葉斑；果膠酶和纖維素酶可使植物組織和細胞解體造成潰瘍和腐爛；氣孔或輸導組織被病菌侵染後可導致萎蔫和枯萎；葉綠素合成代謝的破壞則造成植株缺綠；病原菌產生的吲哚乙酸等生長素類物質可使區域性組織細胞過度增生而產生畸形、樹癭等特殊形態。植物一旦受到病原微生物的危害之後常常會給某些條件致病菌造成侵染的機會，兩類微生物的雙重侵染又進一步加重了對植物的損害。植物病害對農業、林業及畜牧業的發展造成了重大的威脅，嚴重時甚至會影響到一種作物在某一特定地區種植的可能性，在病害高發區種植的作物產量極低甚至會顆粒無收。（1）植物病原真菌（2）植物的細菌性病害（3）植物的病毒性病害