因為在生化危機1中的人工智慧紅皇后變成了他最大的對手，她控制了喪屍攻擊人類，要把人類滅絕，現在威斯克沒有把握打贏她，才要找愛麗絲幫忙，同時，盧瑟捱了一掌後，心臟驟停，因此盧瑟掛了，但是愛麗絲雖然也捱了一掌，但是她用胳膊擋了一下，心臟沒有驟停，所以沒掛。由“保護傘”公司最初研製的足以將人轉變成殭屍的T型病毒仍然在地球上瘋狂地蔓延著、肆虐著，威脅著要將所有的人類都轉變成行動遲緩、嗜血如命的活死人。作為整個世界最後也是惟一的希望，沉睡的艾麗絲（米拉·喬沃維奇飾）這一次是在“保護傘”最機密的運作中心醒來的，隨著她更深入地挖掘進這裡面錯綜複雜的謎團的核心部分，她那充滿著神秘色彩的過去也被一點點地揭露了出來。對於她來說，這個世界沒有任何地方是絕對安全且隱蔽的，她只能主動出擊，一個接著一個地抓捕那些需要對這場病毒的爆發負責的人，從他們的口中探知到她想要的真相。 一些若隱若現的暗示和線索讓艾麗絲一路從東京追擊到紐約，然後又從華盛頓輾轉到莫斯科，最終卻給她帶來的是一系列相當令人震驚的可怕的啟示，也逼迫著她不得不重新思考她曾經以為就是確鑿的事實的一切。不但找到了新的同進同退的戰友，還有以前熟悉的老朋友的迴歸，在他們的幫助下，艾麗絲必須得想辦法在這樣一個異常殘酷的環境裡活下去，因為只有這樣她才能爭取到足夠多的時間，在瀕於毀滅的地球上一邊逃亡一邊尋找真相，畢竟她已經沒有任何迴旋的餘地了。