花椒樹死亡的原因主要是花椒葉鏽病、根腐病、黑脛病（流膠病）和花天牛、潛葉跳甲、銅綠金龜子、桑白蚧、癭蚊等病蟲所致。防治方法：整形修剪清除花椒樹的枯枝爛葉及樹下的雜草，一併燒掉，同時土壤噴灑3-5度的石硫合劑。給花椒樹普遍噴灑1次0.3-0.5度的石硫合劑，或噴灑65%的代森錳鋅500倍液。對染有花椒根腐病和癭蚊的根要剪除燒燬，同時剪口處塗抹石硫合劑。給花椒樹普遍噴灑1次0.3-0.5度的石硫合劑，或噴灑65%的代森錳鋅500倍液，對染有花椒根腐病和癭蚊的根要剪除燒燬，同時剪口處塗抹石硫合劑液消毒，並施以草木灰水。塗抹藥劑於冬徹底刮底刮除有黑脛（流膠）病潰瘍病斑，然後用石硫合劑摻合石灰，調製成糊狀，塗病斑處，或將硫酸銅、石灰、水三者按1：3：15的比例配合塗抹。末受害的椒樹基部可塗抹石硫合劑，防止病害侵入。如發現花椒天牛、潛葉跳甲等害蟲的卵粒與幼蟲，應及時刮除殺死。樹幹莖部的皮刺、翹皮也要全部刮除，並在蟲孔注射100倍敵敵畏藥劑或將碾細的萘丸粉，包在棉花中塞進孔裡，用黃泥封閉蟲孔，可殺死花椒天牛。

花椒葉鏽病，廣泛分佈在陝西、四川、河北、甘肅等省的花椒栽培區。

花椒褐斑病，初期花椒葉面出現黃色圓形的小斑點，呈水漬狀邊緣不明顯，葉背對應部位呈現退綠斑。