第一次去你無法得到4-7島的船票。打完第一次四大天王，並且收集到60個圖鑑，博士就會給你去1-3島的船票。到精靈中心和馬沙奇的朋友說話，再到火焰山，打敗洞口前的兩個火箭隊。在洞裡可以得到寶石，再去精靈中心和馬沙奇的朋友對話，就可以得到4-7島的船票

如果圖鑑種類達到60以上就可以找博士換取386圖鑑.然後,用飛天飛到石英高原發現四天王的挑戰被暫時取消了,因為冰系天王KANSU離開了,去了桔子群島.回到枯葉市港口坐船到1號島嶼,到大型pc大廳內找機器前邊的工作人員對話,得知紅藍寶石被盜.來到原來捕捉火焰鳥的山會發生火箭團劇情,分別打敗兩個人之後就可以進入洞穴,再深層得到紅寶石,把寶石交給工作人員,這時再去港口的時候會發現4-7號島嶼的航線開通了,在4號島嶼的冰洞找到07號秘傳機(逆流而上 攻擊技巧,移動中可以爬上瀑布)後爬上瀑布會看到冰系天王KANSU,幫助他打敗火箭團員後可以繼續向6號島嶼前進了,進入6號島遺蹟(門口用居合斬即可進入)後在深層拿到藍寶石,但是寶石被火箭團的研究人員搶走,於是來到5號島,發現原來鎖著的火箭團基地現在可以進入了,經過傳送帶來到研究室,打敗研究人員以後就可以奪回藍寶石了,帶著這顆寶石來到1號島嶼的pc大廳交給工作人員,就可以啟動大型機器了.回到花田市,用乘浪遊至左上的洞穴前,發現原來看門的人已經離開,進入洞穴會遇到很多高等級的pm,沒有訓練員挑戰,在最深層可以