在檸檬樹還是幼苗的時候，要做好摘心工作，還要及時處理掉病弱枯枝。在掛果的時候，要修剪掉太茂密的枝葉，應很好的控制副枝的數量。盛產的時候要讓果實保持均勻狀態，所以要適當修剪弱果。在它衰退期間，產量就會降低，這個時候為了保持產量，要將瘦弱枝條以及部分側枝修剪掉。

一、幼苗修剪

檸檬樹在幼苗的時候生長是非常快的，也是萌芽和生長新枝的重要階段。在這個時候修剪一定要適當，主要以控制主枝的數量為主，留出適當的距離，並且整個植株的樹冠處於球形最佳。其次，就是摘心和處理掉病弱枯枝。

二、掛果修剪

在這個時期的修剪主要就是控制副枝的數量，控制枝條的生長位置，控制整株的枝葉密度等等，如果枝幹因掛果而出現了下垂等的其它情況，要酌情使用木棍進行支撐，以免枝幹折掉。

三、盛產修剪

這個時候需要觀測整棵樹掛果的情況，儘量讓整棵樹的掛果保持均勻的狀態。還有它的梢、果的生長機儘量保持平衡，當心大小年，所以要適當疏剪。

四、衰退修剪

植株也是有壽命的，到了它的生長年限之後，它的產量就會逐漸的降低。如果修剪合理的話，產量還是會有所保持的。這個時候要廢除大部分的瘦弱枝條了，還要剪除主枝上的部分側枝，促進新枝的生長，結合水肥充足的補給，能有效的穩定產量。