一般沒事，甲基橙、甲基紅等酸鹼指示劑屬於偶氮染料，偶氮染料一般致突變性並不強，即使是前些年鬧得沸沸揚揚的蘇丹紅（也是偶氮染料），致突變性也不強，洗乾淨就沒事了。

甲基綠、甲基紫等屬於三苯甲烷類染料，中學化學中的酚酞和品紅（用於檢測SO2）其實也屬於三苯甲烷類染料，毒性和致突變性也不大，紫藥水（甲基紫的水溶液）今天也沒有完全被淘汰。

真正要注意的是一些含有完整對醌式結構（暴露氧原子）的生化試劑和藥物，對醌式結構有插入DNA雙鏈間與DNA結合的能力，可能起到抑制DNA複製、抑制DNA向RNA轉錄、致突變等作用。例如放線菌素D結構中的髮色基團部分就存在完整的對醌式結構，可以強烈抑制DNA向RNA的轉錄，因此有劇毒。含有對醌式結構的絲裂黴素C、多柔比星（阿黴素）等抗生素能直接插入DNA雙鏈間，影響DNA的複製，較大劑量下有細胞毒作用，小劑量則有強烈的致突變作用。

放線菌素D、絲裂黴素C、多柔比星等均可作為細胞毒抗腫瘤化療藥物，原理是類似的。

民間有個偏方，青核桃皮對某些癌症有一定的治療作用，其實原理也類似，有效成分是分子中含有完整對醌式結構的核桃醌，因此青核桃皮也是有毒的，中醫解釋為“以毒攻毒”，與西醫以細胞毒藥物進行腫瘤化療的思想可以說是同源（當然中醫原理更加原始和不精確）。