AF和MF不能相互替代，各有用處。AF對焦迅速，有跟蹤對焦功能，拍攝運動物體合焦可能更大。但是，AF有誤差，對同一主體對焦每次的結果都有可能略為不同，對有精確對焦要求的拍攝可能不完全勝任，如景深很短的人物照焦點經常是靠前的眼睛和睫毛, AF可能會力不從心。AF有侷限，主體不在對焦點上不能對焦，主體不在中心對焦點精度會下降，對焦鎖定重新構圖在近距離會造成跑焦，主體反差小不能對焦，主體太暗不能對焦。MF對焦只要自己眼睛好就絕對準確。但現在的35mm單反機對焦屏多為AF設計，以明亮為主，不利於區分實際合焦部位。非全副數字單反對焦屏更小。一塊適於手動對焦的全副對焦屏會對MF很有幫助。平時使用應該首先熟悉掌握自己相機的AF能力和侷限。在AF能力範圍內可以儘量使用AF。一旦AF有困難就換用MF。如果相機有單獨對焦按鈕，建議儘量使用對焦按鈕而不要用快門按鈕啟動對焦。大量職業體育攝影師使用這種方式，可以在動態對焦中隨時放開按鈕取消對焦，但不影響按快門拍攝。因為動態對焦有時會受其它因素影響(如某對焦點臨時被另一物體遮擋或光線變化迅速等)而跑焦。另外一個建議是資金允許，儘量購買可以立即手動對焦的自動對焦鏡頭而無須撥動對焦方式杆。這樣的話，一旦察覺AF有問題，馬上就可以手動調節不錯過拍攝良機。