肥料會造成土壤汙染，肥料中含有的重金屬及其他有毒離子，如:礦質肥料含有砷,輻、鉻、氟等有毒元素、)生產化肥的原料中含有一些微量元素，並隨生產過程進入化肥。其次，肥料會造成水體汙染，上壤，包括肥料中的營養物質可隨水往卜淋溶，進入地卜水和農區水域，造成對水質的汙染。第三，肥料中的氮會造成大氣汙染，汙染途徑主要是在上壤微生物的硝化一反硝化作用卜，使部分氮肥變成亞硝按進入環境，破壞臭氧層，成為溫室效應的原因之一〔)此外，施肥不當還可能直接對食品造成生物和化學汙染。生物汙染是由於有機肥及人、畜糞尿帶有致癌菌造成的，化學汙染則是過量使用氮素肥料導致產品中硝酸鹽含量增加。土壤汙染是農產品不安全的源頭，所以我們應該：一、加強土壤汙染修復。二：合理施肥控制源頭。同時，對新型環保肥料的規定將推動創新肥料產品向多樣化、無公害、成木最低化快速發展：1)不造成使用物件產生和積累有害物質，不影響人體健康(安全性)。2)有利保護或促進使用物件的生長，或有利於保護或提高產品的品質(有效性)。3)對生態環境無不良影響(無汙染性或環境保護性)食品安全總問題是涉及人類發展和食品供應的重大社會問題，不僅直接關係到消費者的生命健康，還涉及生產經營企業的經濟利益。從全域性上看，更是社會穩定和經濟發展息息相關。解決食品安全問題，必須搞清影響食品安全的主要汙染因素，才能對症下藥，防患於未然，保證食品安全，造福於人類。