海洋生物資源的開發和利用已成為21世紀世界各海洋大國競爭的焦點，尤其是隨著海洋環境不斷的惡化，海洋生物資源日益遭受人們大量採集而枯渴，海洋生物多樣性亦隨之遭受破壞。據此，海洋生物基因資源的保護和利用，尤其顯得重要。研究海洋基因組及功能基因，不僅有助於培育出優質、高產、抗病的海洋生物新品種，而且，還有助於開發具有中國自主智慧財產權的海洋基因工程新藥，這是解決海洋藥物資源行之有效的途徑。目前，中國某些高校及科研單位相繼克隆了海蛇毒素、海葵毒素，水蛭素等一批功能基因。並且，開展了基因重組芋螺毒素，基因重組藻藍蛋白及基因重組鯊肝生長刺激因子和基因重組鯊魚軟骨新生血管生長因子的研究，有望開發成頗有潛力的基因工程創新藥物。利用遺傳連鎖圖譜的構建，功能基因的篩選與克隆，以及基因打靶技術的研究，將有助於實現海洋生物多樣性的長期保護和資源的可持續性利用。此外，海洋極端環境深海生物基因資源的研究不僅具有科學意義，而且具有實際應用價值。建立中國深海極端海洋微生物菌種資源庫，探討極端環境下海洋微生物代謝途徑與特性，研究極端微生物特徵蛋白結構與功能，這對探索生命本質和生存極限以及開發新型海洋藥物和海洋生物產品提供了產業化的基礎。開展海洋極端微生物的研究，將對醫藥、化工、環保及國防等領域的發展具有極其重要的意義。上海市眾多的高等院校和科研單位擁有雄厚的生物技術力量，開展海洋生物多樣性及其功能基因資源的研究具有很大的優勢。