魚油DHA是從金槍魚等深海魚的油脂中提取的DHA，其性質相對來說是比較活躍的，但也是很容易氧化變腥。但是由於海洋重金屬的汙染，還是不適合孕婦和兒童食用的，畢竟它的魚腥味重。

藻油DHA相對於魚油DHA來說就比較直接和安全。它是直接從海洋單細胞藻類中提取，沒有經過食物鏈傳遞，也不介入海洋汙染，不含重金屬及EPA，純植物性的DHA補給起來會更容易吸收，非常適宜所有需要補充DHA人群特別是嬰幼兒及孕婦等食用。

魚食用了富含DHA的海藻，相當於直接純淨的DHA經過魚的消化吸收，在魚體內不斷積累下來的，這樣的DHA純淨度會大大折扣。而藻類自身就是DHA非常豐富的載體，因此直接服用藻油DHA，是一種更加高效直接的方式。

魚油其實是源於魚類脂肪，因此它的EPA(二十碳五烯酸)含量就會很高，相對的DHA佔比就會過低，對於無法母乳餵養的嬰兒，它的DHA含量是無法滿足孩子的健康成長的。相比之下，藻類的DHA含量就會更高，因為它的DHA是自身合成的，是不經過食物鏈傳遞的，所以在純淨度以及DHA佔比上要大大強過魚類DHA。

魚油作為海魚提取物，腥臭的味道是不可避免的。而海藻油DHA作為一種植物提取物是沒有這種腥味的。不過，經過科技的發展，現在魚油DHA的腥味已經可以忽略不計了，所以，事實上，二者口感其實差不多，但是某些非優質魚油腥味還是很重。

從安全性上來講，除深海魚外，普通魚類會不同程度地受到汞、鉛等重金屬或砷等有害物的汙染，而海藻DHA則不會有這種顧慮。安全無汙染。容易吸收，更適合懷孕，哺乳期的婦女和嬰幼兒。

綜上所述，藻油DHA更好。