水解奶粉和氨基酸奶粉都是針對治療牛奶蛋白過敏的寶寶食用的。

氨基酸配方奶粉可以減小過敏反應；深度水解蛋白質配方奶粉，就是將牛奶中的大蛋白水解成小蛋白分子，促進消化和吸收。

氨基酸奶粉和深度水解奶粉的區別最根本的就在於蛋白質結構不同，深度水解奶粉將蛋白質降解為寶寶可以吸收的氨基酸和短肽鏈。而氨基酸奶粉則是用氨基酸取代蛋白質，寶寶的免疫系統、消化系統更好吸收，加上本來蛋白質進入人體系統也是要被分解成氨基酸的，不必擔心造成營養的流失，是過敏寶寶最好的主食替代。

氨基酸奶粉和深度水解奶粉的區別還表現在致敏程度的不同，因為寶寶牛奶過敏的過敏原就是牛奶蛋白，深度水解奶粉中的短肽鏈使得它依然存在一定的致敏風險，如果是易過敏體質或者是過敏症狀畢竟激烈的寶寶可能還是會出現之前的過敏情況。而完全用遊離氨基酸取代了蛋白分子的氨基酸奶粉才是真正的無敏配方。

氨基酸奶粉和深度水解奶粉在結構上，是有很大的不同的。雖然都是屬於經過特殊調製的奶粉，但是兩者結構不一樣。氨基酸奶粉含有的是遊離氨基酸，這種物質能夠取代蛋白分子，不會破壞掉營養成分，有利於寶寶更好吸收。深度水解難分是將蛋白質分子溶解分開來，還是存在讓寶寶過敏的機率，如果是特別敏感的寶寶，建議慎重食用。

氨基酸奶粉和深度水解奶粉的區別還在於抗敏程度。半週歲之後的寶寶，身體發育還算完善，基本上喝前者是沒問題的，而後者依然存在過敏風險，需要掌握好餵食的量和時間，避免出現過敏反應

主要區別就是：針對寶寶過敏程度不同

氨基酸配方為植物氨基酸混合配方，不含一點牛奶成分，屬無牛奶配方。適於牛奶過敏的診斷和重症的治療。

深度水解配方為牛奶蛋白經工業化加工後的短肽配方，屬牛奶配方。適於牛奶過敏的治療，但不具診斷價值。

特殊配方奶粉分為： 深度水解蛋白配方奶粉和氨基酸配方奶粉。 這兩種特殊奶粉必須要由醫生開處方指導購買，要在醫生的指導下給寶寶食用。

適度水解、深度水解以及氨基酸奶粉的區別

這三者的區別，可以舉一個例子說明： 對那些對牛奶蛋白過敏的寶Bora說，牛奶裡的蛋白質就好比用樂高積木搭成的一個可怕的怪物，寶寶見了會害怕，於是喚醒了體內的免疫系統來與這個“怪物”戰鬥，然後溼疹等過敏症狀就出現了。

1、對於那些具有高過敏風險的寶寶，比如父母曾經有食物過敏史等等，為了預防寶寶見到怪物會害怕，我們就預先把牛奶蛋白質水解成一些大小不等的肽段，這就好比把樂高積木搭的這個怪物給拆成了大小不一的部分，看起來已經不那麼可怕了。這就是部分水解配方奶粉。

2、對於一些十分敏感的寶寶，即使把怪物拆開了，其中的一些部分仍然讓他們感到害怕。這時候，我們只好把積木再拆的更零碎一些。對於蛋白質來說，也就是進行深度的水解，使之只剩下很小的一些肽段，這就是深度水解配方了。

3、然而，還有的寶寶確實是特別敏感，那隻好繼續拆，把積木完全拆成一塊一塊的。對於蛋白質來說，也就完全變成了一堆氨基酸，這就是氨基酸配方了。 簡單說就是： 部分水解配方是用來預防過敏，深度水解和氨基酸配方，則是用於那些已經出現了牛奶蛋白過敏症狀的寶寶