子：秦懷道（625年－684年2月21日），字理，秦瓊死時秦懷道14歲。

子：秦？道（墓誌銘闕字），右衛左郎將，娶尉遲寶琳女。

孫：秦景倩，越州山陰縣令。

孫：秦佾（？－698年），潞州司法參軍。

孫：秦利見，許州鄢陵縣丞。

1995年山東濟南考古人員發現秦愛墓誌銘，終於揭開秦叔寶家族之謎。秦瓊曾祖父秦孝達、祖父秦方太、父親秦愛字季養，三代人都做過北朝時期的文官。

秦懷道墓誌銘沒有記載其父名諱，又刻於開元六年（718年），距其去世時間相隔34年；另外秦懷道之子秦佾墓誌銘中又記載秦佾“祖叔寶，佐命功臣、左武衛大將軍、上柱國、翼國公。父懷道，太宗文皇帝左千牛。秩滿，遷綿州司士參軍。又遷常州義興縣令，襲爵歷城縣開國公。”

綜上可知秦懷道墓誌銘應是誤將其祖、父寫成曾祖、祖，秦懷道應是秦瓊晚年幼子。

擴充套件資料：

秦瓊去世時秦懷道14歲，他釋褐任千牛備身（禁衛武官，執“千牛刀”負責皇帝的安全），任期屆滿後改授綿州司士參軍，又轉常州義興縣令（今江蘇宜興市），襲封歷城縣開國公。

嗣聖元年二月一日（公曆684年2月21日）遘疾終於括州括蒼縣(今浙江麗水市)，年六十。嗣子前越州山陰縣令秦景倩，開元六年（718年）十二月廿三日將他改葬於洛陽縣清風鄉之原。