部隊嘉獎和三等功的區別如下：

一、獎勵待遇不同

對獲得三、二、一等功獎勵的個人，分別授予三、二、一等功獎章，對獲得三、二、一等功獎勵的單位頒發獎狀，對獲得三等功以上獎勵的義務兵，可以提前晉銜。

獲得嘉獎的個人或單位則沒有具體的獎勵。

二、獎勵的條件不同

個人或者單位遵守紀律，在作戰、訓練或者其他工作中的某一方面表現突出，取得優良成績或者被評為優秀士兵的，給予嘉獎。

個人遵守紀律，有下列表現之一的，按照下列規定給予三等功：

1、學習馬克思列寧主義、毛澤東思想和鄧小平理論，貫徹黨的路線、方針、政策，聯絡實際回答和解決重大理論和現實問題，成績突出，有較大貢獻的，可以記三等功。

2、戰鬥中英勇頑強，堅決執行命令，模範遵守戰場紀律，完成作戰任務成績突出，或者主動掩護、搶救戰友，事蹟突出，有較大貢獻的，可以記三等功。

3、戰鬥中勇於克服困難，積極主動、迅速有效地提供後勤、技術或者其他作戰保障，對完成作戰任務有較大貢獻的，可以記三等功。

三、獎勵的許可權不同

根據《華人民解放軍紀律條令》第二十條規定：

對義務兵實施獎勵的許可權為嘉獎由連、營批准，三等功由團、旅批准。