光合細菌和EM菌一個是單菌種一個是複合菌種，都是屬於有效微生物在作用不能和防毒劑混合使用！不然會影響菌種效果！但是可以於肥水王一起使用！

EM菌（Effective Microorganisms）是由大約80種微生物組成，自日本引進後，在中國的種植、養殖、水產等高產高效方面創造了許多奇蹟。 　

由以下5大類菌組成的：

　1、光合菌群（好氣性和嫌氣性）。如光合細菌和藍藻類。屬於獨立營養微生物 ，菌體本身含60%以上的蛋白質，且富含多種維生素，還含有輔酶Q10、抗病毒物質和促生長因子；它以土壤接受的光和熱為能源，將土壤中的硫氫和碳氫化合物中的氫分離出來，變有害物質為無害物質，並以植物根部的分泌物、土壤中的有機物、有害氣體（硫化氫等）及二氧化碳、氮等為基質，合成糖類、氨基酸類、維生素類、氮素化合物、抗病毒物質和生理活性物質等，是肥沃土壤和促進動植物生長的主要力量。光合菌群的代謝物質可以被植物直接吸收，還可以成為其它微生物繁殖的養分。光合細菌如果增殖，其它的有益微生物也會增殖。例如：VA菌根菌以光合菌分泌的氨基酸為食餌 ，它既能溶解不溶性磷，又能與固氮菌共生，使其固氮能力成倍提高。

　　2、乳酸菌群（嫌氣性）。以嗜酸乳桿菌為主導。它靠攝取光合細菌、酵母菌產生的糖類形成乳酸。乳酸具有很強的殺菌能力，能有效抑制有害微生物的活動和有機物的急劇腐敗分解。乳酸菌能夠分解在常態下不易分解的木質素和纖維素，並使有機物發酵分解。乳酸菌還能夠抑制連作障礙產生的致病菌增殖。致病菌活躍，有害線蟲會急劇增加，植物就會衰弱，乳酸菌抑制了致病菌，有害線蟲便會逐漸消失。

　　3、酵母菌群（好氣性）。它利用植物根部產生的分泌物、光合菌合成的氨基酸、糖類及其它有機物質產生髮酵力，合成促進根系生長及細胞分裂的活性化物質。酵母菌在EM原露中對於促進其它有效微生物（如乳酸菌、放線菌）增殖所需要的基質（食物）提供重要的給養保障。此外，酵母菌產生的單細胞蛋白是動物不可缺少的養分。

　　4、放線菌群（好氣性）。……

　　5、發酵系的絲狀菌群（嫌氣性）。……

而光合菌只是EM菌的其中的一種

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